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核酸适配体(aptamer)相关知识及方法交流

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  • 自然学科
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    想要做一个适配体比色生物传感器,目前拟用金纳米粒子作为载体材料,显色液为TMB ,核酸适配体的载体材料有哪些,具体应该如何选择?
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    有研究者做核酸适配体的应用,直接把做抗体的方法搬过来。发现有问题,开始吐槽适配体不好。在这里,不是要为核酸适配体辩护什么,更不是要为我们的适配体辩护什么。是想客观地分析大家可能碰到的问题,然后再想想如何解决? 核酸适配体和抗体是完全不同的分子,所以在应用上也有一些差异,直接去照搬抗体的应用方法,绝大多数情况下是不可以的,原因是什么? 要解释这种现象,需要从分子识别的本质上来做一个分析。 不管是抗体识别
    sqc 9-26
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    前几天看文献看有一篇文献,利用软件构建了核酸适配体的模型,并与目标蛋白进行比对,大致确定了CTLA-4蛋白与其适配体的结合位点。 分子对接不是问题,关键是能否用Discovery Studio完成对我所需适配体结构模型的构建。 原文献标题:A CTLA-4 Antagonizing DNA Aptamer with Antitumor Effect[J]
    tcjiusi 12-14
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    小白弱弱问一句,怎么测适配体的Kd值呢
    半夏LQY 3-16
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    经核实吧主memoryfxn 未通过普通吧主考核。违反《百度贴吧吧主制度》第八章规定http://tieba.baidu.com/tb/system.html#cnt08 ,无法在建设 aptamer吧 内容上、言论导向上发挥应有的模范带头作用。故撤销其吧主管理权限。百度贴吧管理组
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    核酸适配体领域的博士想去企业,大家有什么推荐的吗?最好在苏州
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    此路不通—— 利用核酸适配体结构变化来检测新冠状病毒N蛋白 【更新】2020.03.23 廖老师说他的分子信标实验可以实验,目前在优化。(看来我觉得不行,是自己太弱。不过廖老师的实验还有待继续验证和优化。有进展再更新。) 以下是原始文件。 核酸适配体之所以受到大家的关注,有它独特的魅力。可以设计成分子信标,实现一步均相检测。这种方法对于使用来说,超级简单。它可以实现一个完全的均相检测,不需要加入其它的东西,可以使检测
    安逸琪 4-12
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    以下按照提问的先后顺序,依次进行回答,并尽量实时更新: 知乎上会实时更新,链接为:https://zhuanlan.zhihu.com/p/108304397 11、如何获得? 答:链接:https://www.aptamy.com/productinfo/1441285.html 【第一批SH、NH2、biotin等修饰适配体将于周三发货】,或者邮件发送适配体货号向 苏州贝信订购。目前仅限两家合作企业,品质有保障。以上两家企业的产品提供亲和力测试质控。 序列公布出来后,可以自行找公司合成即可。需要注意的是,不同公司合成的品质存在差
    安逸琪 3-31
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    新冠S1蛋白的适配体,终于可以说说了 疫情之下,几多艰难! 人手有限,租人租场地搞新冠适配体筛选研究,我们的动作还是太慢! 2月19日就拿到了S1蛋白的适配体,因为有些数据没搞清楚,一直不敢发布出来。 1个月过去了,依然还在做分子水平的实验。当然了,我们并没偷懒,一直在测试。 并且获得了一些可信的结果。我们至少有以下几种适配体经过了多次的测试和验证。 直接上图: 新冠病毒S1蛋白的2条核酸适配体以及截短的适配体 可靠的已
    安逸琪 3-31
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    新冠状病毒N蛋白的核酸适配体信息共享转载自知乎-罗昭锋
    安逸琪 3-4
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    关于适配体与靶标蛋白的结合,结合缓冲体系里的阳离子是必须的嘛?
    memoryfxn 9-25
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    液滴内的相互作用:亲水性试剂是如何透过油相的?
    memoryfxn 6-14
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    点击展开,查看完整图片
    memoryfxn 6-11
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    【题记】想了解一下核酸适配体在血清中的应用。所以做了一个调研,这是调研结果的小小总结。分享给大家,也许能给需要的朋友节省点时间。 文末附文献调研的整个过程
    memoryfxn 6-5
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    微孔阵列法快速生成均匀琼脂糖微滴和微珠用于单分子分析 研究背景 微流控技术一般是指利用微尺度下流体的流动性质 进行物质分离、检测并辅以某些主动或者被动操控措施的技术。微流控技术由于将反应容器的体积降到了纳升以下,使得试剂消耗量变得极小,极大的降低了操作成本。微小的反应容器同时也具备极高的分析效率,可以带来高通量的检测并减小了反应时间。 文章中使用了超低凝胶点的琼脂糖,这种琼脂糖溶液在高于56摄氏度的时候是
    memoryfxn 6-7
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    研究背景 肿瘤免疫机制: 抗肿瘤免疫反应有效杀伤肿瘤细胞,需要经历数个步骤:肿瘤形成后生成新抗原,释放入机体后被树突状细胞(dendritic cell, DC)捕获;DC将捕获的抗原递呈至T细胞;效应T细胞激活,产生对抗癌症抗原的特异性免疫反应;活化的效应T细胞迁移至肿瘤床;活化的效应T细胞在肿瘤床浸润; 效应T细胞特异性识别并与肿瘤细胞结合(通过同源抗体与组织相容性复合物I结合);目标肿瘤细胞被杀灭;被杀灭的肿瘤细胞进一步释放更多肿
    memoryfxn 5-25
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    背景介绍 核酸适配体筛选过程中,单链制备是非常重要的一步,单链的质量也关乎筛选的成败。 单链制备方法有多种,发表文献里常见的方法有以下几种: 1、Biotin修饰引物后用SA磁珠分离方法;2、长短链法;将反义链加长,需要电泳跑胶分离两条链;3、酶解法:可以使用lambda酶切,成本较低,但是可能出现不完全酶切;4、不对称PCR法:条件不是很好控制。 (参考文献:Marimuthu, C., et al. (2012). "Single-stranded DNA (ssDNA) production in DNA aptamer generation.&qu
    memoryfxn 5-25
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