代谢组学吧
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    大家好,我想请教一下代谢组数据上传的问题。我是无法上传代谢物的注释信息,上传Metabolite annotation的文件不显示,不知道哪里出错了。手动输入的话有3000多个代谢物,很慢。网络找到的攻略具体的流程是⑰进入Metaboliteannotation填写,有两种方式:可以选择upload上传系统能够自动识别的txt文件File:m_MTBLS4669_LC-MS_positive__metabolite_profiling_v2_maf.tsv,该文件可在本网页上download下来然后填写metabolitesidentification、massto charge(m/z)、retentiontime(RT)、Modification(ad
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    想问一下大家鉴定化合物有用Sirius鉴定的吗,运行出来structure那一栏不显示是什么情况,是物质太多的原因吗
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    请教一下大家,做的靶向代谢,聚类热图里面有个组别表达量最高,但是到后面差异代谢物筛选的时候,那个组别跟其他比又呈下调,这是什么意思,聚类热图里面的表达量和差异代谢物上调下调有联系,这种情况该怎么解释呢
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    请问各位大佬怎样可以吧HMDB的库导进MS-DIAL
    白杉猹 5-10
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    做代谢组学用哪种仪器好呢,GC/MS还是LC/MS
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    请教大家,总离子流图(TIC)是质谱色谱共同得到的图吗?总离子流图的峰上面的质荷比和保留时间是否就可以确定这个位置的峰就是哪个物质?
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    我研究的是中草药在凡纳滨对虾饲料中的研究,现在是有一个18%鱼粉为正对照组PC,12%鱼粉为负对照组NC,负对照的基础上添加了中草药为EA组,我现在很头疼这三个组怎么分比较组更好,老师觉得应该PCvsNC,PCvsEA,NCvsEA,求组学大佬指教,谢谢大家!
    绿星1217 4-22
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    请问做血浆gc-mc一个样本大概多少钱?
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    请问有人使用过CD软件吗 想问一些问题 就是 A B 两种物质 想知道他们差异 用CD软件一起进行扫描 还是要分开再对比
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    合作文章|Advanced Science:ECSIT是通过调节YAP蛋白翻译控制肠道稳态和肿瘤发生的关键因素 英文标题:ECSIT Is a Critical Factor for Controlling Intestinal Homeostasis and Tumorigenesis through Regulating the Translation of YAP Protein 中文标题:ECSIT是通过调节YAP蛋白翻译控制肠道稳态和肿瘤发生的关键因素 发表期刊:Advanced Science 影响因子:15.1 技术手段:小鼠结肠和小肠组织LC-MS/MS广泛靶向代谢组学 敏心生物协助南京医科大学发表文章于中科院1区Advanced Science 7月6日,南京医科大
    Aid004 1-11
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    https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkyMjQ0NTA5OA==&mid=224748
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    代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞、生物流体、组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。
    Teemoog 3-23
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    有做代谢组学的大家可以相互交流学习
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    代谢组学及网络药理学专题课程来袭! 一、代谢组学研究技术与实践 1.代谢组学数据采集与预处理 2.基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操 二、网络药理学研究技术与实践 1.网络药理学数据分析与实操 2.化学成分的获取与筛选 3.中药化学成分靶点获取 4.疾病靶点富集数据库 5.化合物与疾病靶点映射 6.PPI网络分析,富集分析 三、代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践 1.代谢组学与网络药理学数据的获取 2.代谢组学功能分析,代谢小分
    兰珍360 11-25
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    我这有一份代谢数据 分为四个表格 训练集阴离子 训练集阳离子 验证集阴离子 验证集阳离子 训练集有25个样本 验证集有41个样本 我想进行pca 和pls-da 但是 数据预处理完全不会!! 我是应该将四个表格的数据放在一起还是其他方法呢 ? 或者使用 metaboanalyst 进行分析之前 我该怎么处理这份数据啊 刚接触这个知识 求大佬讲解!!!!
    中药鉴定 11-24
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    UU们,有一事相问农作物代谢组学方向好就业不,这个是生物方向吗?代谢组学是生物方向,但是加上农作物就不知道了
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    本人最近帮导师搞一个关于血液的代谢组学的课题,不知道是选用血清还是选用血浆。血清吧,血液凝固的时候可能造成部分蛋白成分的丢失;血浆吧,又担心抗凝剂对后来的结果造成干扰。。。。。烦呐! 哪位高手帮帮忙,指导一下。 knee已跪烂。。。。。。
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    之前课题组没有代谢组学研究背景,刚刚涉及这一领域,求问吧里的大神,要想开始这方面的研究,需要哪些仪器设备及软件呢?目前我知道的是LC-q-tof-MS,GC-q TOF-MS,Simca软件,spss,metlab,求问用液相用三重四级杆质谱可以么?一开始是应该先建立各种代谢物的定量检测方法呢还是先优化样品中的分离方法呢?没有头绪,求教
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    通过GC-MS检测血液样本 分析哮喘病人的代谢物组信息变化 研究对象:人血 分析检测平台:GC-TOF/MS (BIOTREE) 期刊:Acta Pharmacologica Sinica 影响因子:2.912 发表时间:2015 摘要: Aim: To character the specific metabolomics profiles in the sera of Chinese patients with mild persistent asthma and to explore potential metabolic biomarkers. Methods: Seventeen Chinese patients with mild persistent asthma and age- and sex-matched healthy controls were enrolled. Serum samples were collected, and serum metabolites were analyzed using GC-MS coupled w
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    开此贴是为了与大家互相交流学习那些我们在代谢组学中可能会遇到的问题。 此贴长期更新,吧友们留言讨论,我看到后就会回复。 开贴庆祝
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    请各位做过的前辈们讲下经验,举几个例子
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    求讲解一下组学分析时上样顺序应该是怎么样的?如QC样的插入、空白样的插入之类的问题
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    有没有大神指导一下,我是送公司做的代谢组,得到的数据该怎么分析啊!!
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    所里有一台闲置compound discover 3.2工作站,不用排队,直接非靶搜库,验证和补充公司数据。内源性代谢物,天然产物,肠道菌群代谢物等,基于mzcloud,mzvault,chemspider搜库。QQ:1755258545
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    试验原因要用gc-mc测牛奶的代谢组学,但是国内的文献没有用gc测过牛奶的…sci中也寥寥无几…有没有做过这个的大神啊?
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    为了帮助大家更好地了解代谢组学研究的方法及其在临床医学上的应用,上海百趣与赛默飞携手丁香园,邀请多位该领域的优秀专家及大咖,于 4 月 28 日 14:00 展开一场围绕「代谢组学前沿技术在临床医学的应用」学术研讨会。
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    组学服务商涉及方面太多,既包含CRO公司品牌、商誉、组织人才、实施案例、客户口碑、公司大小,还包含技术细节、设备实力、人才能力、数据处理能力、服务效率、服务人员是否经验丰富、数据库量和质,此外,还有自己的资金支持、重视程度、目标层次不同等自身需求原因,选择哪个公司作为服务商,好比投资公司一样复杂。 代谢组学又包含样本前处理、数据获取、峰检测、峰对齐、差异特征筛选、化合物鉴定、二级谱验证、定量检测等流程
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    医学生物信息学公共数据深度挖掘临床应用培训班 2022年01月20号--23号 医学SCI临床科研思路国自然撰写培训 12月23号--26号 多组学数据分析及挖掘临床应用培训班 2022年01月07日-01月10日 课程大纲: 一、基因组学及生物信息学概述 二、组学技术介绍 三、基因组学实验设计及数据分析 四、转录组学实验设计及数据分析思路 五、表观组学——DNA甲基化和RNA的联合分析 六、表观组学——公共数据库及工具介绍 七、多组学数据整合分析思路介绍 八、多组学数
    chunjiaoyy 12-22
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    Metabolomics(代谢组学)是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴组学技术,是系统生物学的重要组成部分。其对生物体内所有小分子代谢物进行定性定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系,其研究对象大都是分子量1500以内的小分子物质。 为感谢新老客户多年来对BIOTREE的关注与支持,正逢辞旧迎新之际,BIOTREE特别推出非靶标代谢组学免费预实验的活动(限两个样本)。10个工作日出结果,基金申请,研究背景、工作基础都靠它了,
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    谁有肠道菌群和代谢组学课题设计的课程呢
    kalo73 8-8
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    BIOTREE推出新品“发现代谢组学”,为什么百趣生物要开发“发现代谢组学”产品呢?Biotree研发团队在研发中如何攻克难点?“发现代谢组学”有什么特征,又有什么产品优势呢?跟随小趣一起看看“发现代谢组学”——用体系的力量解决无限的需求吧~ 什么是“发现代谢组学” “发现代谢组学”通过研究实验组和对照组中有哪些代谢产物有统计学意义上的显著差异,从定性和半定量角度发现“代谢组”上的差异,进而研究这些代谢物与生理病理变化
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    想学的留邮!
    GTV小粉 6-22
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    一、代谢组学研究技术与实践 1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨 1.1 代谢组学概述 1.2 代谢组学操作流程 1.3 样本的采集、储存与制备关键问题 2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性 2.1 常用技术平台介绍(NMR和LC-MS) 2.2 常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定、数据预处理与分析) 2.3 数据预处理,包括数据归一化、标准化和数据转化以及缺失值评估等 3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操 3.1 样本分
    Angus_01 6-16
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    代谢组学及网络药理学研究在线直播实战课程 两阶段(软件基础+案例进阶)教学、班级群跟踪辅导!助力科研我们是认真的,快快加入我们吧! 1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨 2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性 3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操 4、网络药理学研究思路和流程 5、网络药理学数据分析与实操 6、代谢组学与网络药理学结合研究思路 7、代谢组学与网络药理学结合分析技术
    鱼幼薇 5-24
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    脂质组学是对整体脂质进行系统分析的一门新兴学科,通过比较不同生理状态下脂代谢网络的变化,进而识别代谢调控中关键的脂生物标志物,最终揭示脂质在各种生命活动中的作用机制。电喷雾电离-质谱技术是脂质组学领域中最核心的研究手段,目前已能对各种脂质尤其是磷脂进行高分辨率、高灵敏度、高通量的分析。随着质谱技术的进步,脂质组学在疾病脂质生物标志物的识别、疾病诊断、药物靶点及先导化合物的发现和药物作用机制的研究等方面已展
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    2018年7月阿趣课堂-代谢组学暨多元变量统计分析培训班 1个代谢组学梳理+3大实操课程 特别说明:培训期间,请自备笔记本电脑 以下所有软件实操课程请携带Windows系统的笔记本,建议win7、win10。 1.代谢组学暨多元变量统计分析培训班(2018年7月22-23日 注册费:¥2,000.00/人(包括学费、午餐及欢迎晚宴) 四人团购 赠送迪士尼平日门票或打九折 (仅限平日门票,节假日、寒暑假、周末除外) 培训班内容暂定如下: 1.代谢组学简介及应用 2.代谢组学SCI文
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    一、为什么会有质谱代谢组学数据分析集成平台 1、随着检测设备的快速发展和多组学技术的联合应用,数据规模和复杂程度呈指数上升。 2、代谢组学的机制和转化研究需要有效地利用和挖掘数据中蕴含的生物学信息。 3、面对高通量代谢组学研究中数据的处理和分析这一难点,人们希望运用高效、省时的综合性数据分析全功能软件对其进行分析处理。 二、目前质谱代谢组学数据分析集成平台的现状 1、随着各种组学的日益成熟,多组学整合研究越来
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    大肠杆菌中,果糖抑制剂(FruR)通过中心代谢途径影响碳的流量。这篇研究中,FB-04大肠杆菌通过敲除了FruR基因从而使FruR失活使色氨酸的产量增加。基因敲除的FB-04大肠杆菌(△fruR)不仅展现出更高的生长效率而且还大幅度提升了色氨酸的产量。FB-04(△FruR)大肠杆菌中色氨酸的产量和每分子葡萄糖产生的色氨酸相比于没有敲除的大肠杆菌分别增加了65.5%和52.4%。代谢组学分析,显示基因敲除的大肠杆菌显著提高了糖酵解、戊糖磷酸途径和三羧酸循环
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    购买代谢组学相关产品及对应内标,找南京北鱼生物科技有限公司,一站式服务商,特别是稳定同位素产品,相当齐全,欢迎您的咨询QQ:2245068322 包括:无机物、有机物、糖类、儿茶酚胺系列;激素类系列;维生素系列;氨基酸系列;肉碱系列;胆汁酸系列;新生儿筛查同位素系列;脂肪酸和脂质类;NIST 标准物质所有标品及其系列同位素产品……
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    导读 “对我国的代谢组学而言,发展才是硬道理。当行业经过蓬勃发展后,则更加需要重视发展的质量,重视长久的可持续协调发展。” 随着人类基因组计划工作的完成,生物医学研究进入“后基因组时代”,科研界将关注点拓展至基因型与表型的关联。随着基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学等研究方法的不断发展及相关研究的深入,“表型组及表型组学”的概念应运而生。相对于基因组学,人们对表型组学还比较陌生。 原文分享: https
    KINO 6-3

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