老师叫我们分析蛋白质组学初始数据

求助简单蛋白质组学问题，有偿

美国贝勒医学院研究人员近日在期刊Oncogene上报告，他们分析了大约800种肿瘤的数万种蛋白质数据，包括7种不同的癌症类型——乳腺癌、结肠癌、肺癌、肾癌、卵巢癌、子宫癌和儿童胶质瘤。这些数据是临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)基于质谱的蛋白质组学数据提供的。” 分析结果显示，肿瘤表现出细胞通路的改变，这些通路可能是恶性肿瘤行为的驱动因素，并可能代表新的治疗靶点。每种癌症类型在其侵袭性形式中都表现出独特的蛋白质组学特

组蛋白提取完，也进行了质谱上机，请问哪位大神知道用maxquant怎么搜库呀，修饰要怎么加呀，加什么

#GO##KEGG##蛋白质组##分析#只需提供蛋白ID，或基因名，以及物种名称即可

我也是老祖安了

中科成创（北京）生物技术有限公司 CCATRI-03-1713 关于举办“单细胞测序分析及R语言实战操作在线直播培训班”通知 各有关单位: 随着新一代单细胞测序技术的快速发展，在准确度大大提高的前提下, 进一步降低测序成本。由此不断产生出巨量的分子生物学数据，这些数据有着数量巨大、关系复杂的特点，以至于不利用计算机根本无法实现数据的存储和分析。随着生物信息学作为新兴学科迅速蓬勃发展，正在改变人们研究生物医学的传统方式，单细胞

1楼度娘

GST-pulldown实验是一个行之有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术,近年来越来越受到广大学者的青睐。其基本原理是将靶蛋白-GST融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和填料上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物后通过SDS-PAGE电泳分析,从而证实两种蛋白间的相互作用或筛选相应的目的蛋白,“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”均可通过细胞裂解物、纯化的蛋白、

SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragment ions）由ETH Zürich的Dr. Ruedi Aebersold团队与AB SCIEX共同研发的一项全新的质谱采集模式技术。SWATH作为一种DIA (Data Independent Acquisition)技术，将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口，依次对每个窗口的所有离子进行碎裂，使其能够对扫描区间内的所有肽段离子进行高速一级MS扫描再进行二级MS/MS分析。因此，SWATH能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定。SWATH综合了shotgun proteomics高通量检测的特

非标记定量(Label free) 蛋白质组学技术：Label-freequantitativeproteomics（Labelfree）technolog 定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容，通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来，随着非凝胶技术的发展，“鸟枪法”蛋白质组学（“Shotgun”proteomics）技术，特别是多维蛋白质鉴定（Multidimensional Protein Identification，MudPIT）已成为研究复杂生物样本中大规模蛋白质表达和定性和定量分析的强有力

二甲基Dimethyl标记也是一种同位素蛋白标记的方法。Dimethyl是一种小分子同位素化学标记物，通过化学标记的方法标记细胞裂解后的蛋白或多肽的N端或者赖氨酸的ε氨基基团，使蛋白／多肽标记上不同的Dimethyl标签。Dimethy/SILACl除了标记方法的差别外，两种标记的质谱分析方法基本一致，而且具有相近的分析精度和广度，在定量蛋白组学分析研究中受到越来越广泛的运用。 Dimethyl标记的是酶切后的多肽片段，受到体系稳定性影响更多，因此重复性稍逊于

蛋白质组学技术服务常见的几种服务，已在上篇内容中为大家提供了两种相关的蛋白质组学技术服务详情，包括了蛋白质的鉴定技术服务、定量蛋白组学技术服务。本篇内容中将会为大家带了剩下的蛋白质组翻译后修饰分析技术服务、蛋白质测序技术服务、以及糖蛋白分析技术服务和蛋白质组学生物信息学分析技术服务。 三、蛋白质翻译后修饰鉴定服务 蛋白质翻译后修饰分析技术服务通常是对蛋白质磷酸化、乙酰化、泛素化、糖基化、蛋白二硫键等

分子量是有机化合物基本的理化性质参数。分子量正确与否往往代表着所测定的有机化合物及生物大分子的结构正确与否。分子量也是多肽、蛋白质等鉴定中首要的参数，也是基因工程产品报批的重要数据之一。 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱，具有样品消耗量少、灵敏度高、测定速度快、易于实现高通量、可对蛋白进行大规模的鉴定及生物大分子的分子量测定等特点，为蛋白质研究提

肽谱图分析通常用于蛋白质的鉴定，大多数会用于测定蛋白质的序列。 蛋白样品鉴定过程一般只会使用Trypsin对蛋白进行酶切，鉴定到的肽段覆盖率大概在60%。为了得到靶蛋白的全部序列信息，一般会选用在蛋白鉴定过程中常用的6种蛋白酶（Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C和Lys-N）分别对靶蛋白进行酶切和鉴定，在得到更多的碎裂肽段片段的同时，经过肽段之间的拼接完成蛋白序列100%的测定。 质谱法肽段覆盖率/肽谱图全序列测定的流程： • 首先

非标定量法[Labelfree]是近年来重要的质谱定量方法，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。蛋白质非标记定量技术（Label Free）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。 非标定量法( Label-free) 是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度

度娘吞贴太多，还是放word吧。

2017.10.13——10.16 将在 沈阳 举办一期有关蛋白质组学，质谱分析，蛋白修饰，蛋白定量等相关学习，感兴趣的人员，可以加QQ 1256090094 张老师 微信：zhang13683111214 张老师会将详细的培训资料，发给你。

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蛋白质组学贴吧，吼吼吼

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1、蛋白质组贴吧 http://tieba.baidu.com/f?kw=蛋白质组&ie=utf-8 蛋白质组学群： <a target="_blank" href="http://shang.qq.

亲爱的各位吧友：欢迎来到蛋白质组