毛文龙个人是维系东江镇各方力量的关键，但其作风也引发争议，如被指责“虚报战功、冒领军饷”。1629年，蓟辽督师袁崇焕以“擅杀、冒饷、通敌”等十二大罪为名擅杀毛文龙 。此举使东江镇瞬间失去核心陷入群龙无首的境地。明廷随后对东江军采取“分协”整编，反而加剧了内部权力斗争，将领之间相互攻杀，如刘兴治叛乱、沈世奎与黄龙及尚可喜之间的内斗等，严重内耗使得东江镇实力大损 。
作为对手，皇太极高度重视东江镇的威胁，采取了一系列精准的战略行动。首先，通过征战彻底臣服朝鲜。在1627年的“丁卯之役”后，朝鲜逐渐脱离明朝，并在1637年完全倒向后金。这使东江镇丧失了重要的物资补给来源和战略缓冲。其次，招降纳叛。毛文龙死后，其旧部离心力大增，如孔有德、耿仲明、尚可喜等重要将领在内外压力下，相继携带精锐部队、先进火炮和战船投靠后金。这不仅使东江镇军力锐减，更让后金获得了梦寐以求的水师能力和攻坚火炮技术，力量对比发生逆转 。
在经历了一系列内斗和叛降后，东江镇的实力和地盘急剧萎缩。1637年，皇太极在完全制服朝鲜后，要求朝鲜出兵协助，联合发动了对东江镇最后堡垒皮岛的总攻。尽管总兵沈世奎率部进行了顽强抵抗并最终壮烈殉国，但孤岛难支，皮岛最终陷落 。至此，坚持了十数年的东江抗清体系彻底覆灭。

后世为什么有很多人为袁崇焕喊冤，却没有人为毛文龙喊冤？ - 杨恒的回答
因为洪承畴还没有浮出水面
袁崇焕杀毛文龙的根本原因是路线之争
洪学揭秘了东南财阀收买寄生满清夺舍大明的历史脉络
而东南财阀怎么和远在白山黑水的建州女真发生关系的？真的是从三官庙的那张床上吗？
非也，东南财阀和东北部落的联系从唐末开始就没断过，唐末海上丝绸之路开拓以后，东亚海贸就利用西太洋流循着台湾琉球日本对马岛朝鲜辽东山东浙闽的逆时针循环建立稳定航线，但规模一直有限，东北更多还是依赖北方边关和全世界互通有无，由此养出了晋商及其代言人们，比如于谦、杨洪、张四维、韩爌等朝堂大佬
等到明末，中央朝廷被高度架空，边关高度军阀化以后，边贸进入高潮，人员物资的频繁流动让女真逐渐壮大，边关一边经商走私，一边养寇自重，只重视经济利益，中央失能无法调整地缘战略，导致明朝完全失去东北控制，而北方边军，尤其是辽西边军地位进一步凸显，就此成为帝党、东林之外的决定性军事集团
朝堂上的所有人都在争取辽西边军，而袁崇焕在被选中推到前台之前，正好在福建官场混迹多年，可以说他能在身份低微且遭到吏部尚书直隶人王永光为首的帝党残余反对下，依然能够出镇辽东，少不了东南财阀的鼎力扶持，崇祯没钱没兵，面对孙权困境，他不得不用被硬塞进来的袁崇焕
而袁崇焕的东北政策，也确实是平辽，但不是武力平辽，而是收买平辽，想通过一手拉拢东北边军，一手勾连建州女真，用大规模扩大海上贸易规模，通过生意方式评定辽东
而毛文龙偏偏卡在东亚逆时针洋流天然海路的中间
这就是袁和毛的根本矛盾
辽西和皮岛，一个在渤海西岸，一个在黄海东岸，中间隔了一整个辽东半岛，陆路相隔550公里超过千里，在明代通信条件下，是八竿子打不着的军事关系，袁崇焕是蓟辽督师，毛文龙是东江总兵，东江实际驻地并不在辽东故地，且皮岛实力有限根本无力深入作战，所谓的大捷基本都是打劫，毕竟东江的主要后勤来源依靠的就是抢劫，抢后金治下的辽东农业区，更抢后金的海上交通线，而后者才是让后金和袁崇焕睡不着吃不香的问题根源，皮岛对后金，更像倭寇对明朝的关系
毛文龙卡在朝鲜，袁崇焕及其代表的东南财阀就如鲠在喉，毕竟辽西人多眼杂且时局严峻，显然无法大张旗鼓通金，通不了金，就没法让金朝吐出辽东土地，没有战绩就比不过毛文龙，比不过毛就迟早露馅，压力给到袁崇焕，所以他不得不硬着头皮以身入局千里斩杀毛文龙
袁崇焕杀毛以后直接冷处理东江镇，东江镇再无战绩逐渐消亡，明摆着东江镇对袁没有意义，而没有东江镇才是袁真正在乎得事情
后来袁带着辽西军一边做生意一边刷守功，最终一家独大，做的也越来越放肆，甚至直接在辽西走廊开始光明正大得和关外开市，双边关系不断深入，而膨胀得袁这个时候向朝廷伸手要兼并蓟镇军事及其背后得蒙古，崇祯不许，于是己巳之变发生，这个变，是土木堡之变得边，是庚辰之变得变，一个变字写尽了时间真相，袁以为挟金自重，满兵横刀城下，崇祯不得不许，结果崇祯可是敢自杀的悍主，威胁谁呢？根本不管那么多，直接把袁崇焕下狱
控制住袁崇焕就断了东南财阀和后金得联络，城里得高官抓了瞎，仓促之下根本不敢开城，既怕乱军之中丢了性命，又怕崇祯愣头青搂草打兔子，于是被迫认可对袁崇焕得处理，后金见联络人没了，也没了主意，不知道下一步动作，抢劫一番悻悻而归，己巳之变结束。
孙承宗是直隶人，接管关宁以后一改袁的生意为主战略，主动出击，有所收获后损害了关宁军利益，被做局引咎罢免，其后又一个南方人杨，直接变身蒋介石，大搞攘外必先安内，关宁重回旧局面，因镇压农民军不利，畏罪自杀，接着就轮到洪承畴登场了

明人也防汉啊 把能干事的全杀了

只要能黑袁崇焕，这群毛文龙粉能给你现场编造一本小说。

这么细的一条路实在是太可怕了

所有人都只是看表面上的得失，实际上内因是明国库缺钱，要么想收缩防线少花钱又怕毛文龙反水到后金，干脆找借口剁了再找机会慢慢收兵（实际上这种骚操作的事情明后期没少干，戚家军啥的）结果陷入越想省钱越多问题出现的恶性循环直到裁员李自成

所有夸耀毛文龙的人都绕不开一个问题：是皮岛有用，还是旅顺有用？
如果是毛文龙的皮岛有用，那为什么满清打的频率那么低？（旅顺在天启、崇祯这不足10年的时间，就有过3次万人以上的进攻，满清还派了2千正规军来专门盯着旅顺）
如果是张盘所在的旅顺有用，那毛文龙又对旅顺做了哪些贡献？（千里之外的军事指挥？后勤？军事消息？军事支援？）
想一碗水端平也是不可能的，因为张盘从头到尾都只有几千人，兵力远少于毛文龙。

皮岛现在都成朝鲜的了，唉

海洋上，郑和舰队沿印度洋完成了“明代元”官方程序，包括灭了不服大明王化(如继续奉元为正溯)的沿海邦国，并在一些关键港口建立了明廷直接统治和税所，所以也继承了宋元以来的大航海红利。但在陆上，替代范围和速度远不如海上，国力被东南海商勾结陆上蒙元余孽持续消耗、乃至不得不天子守国门。明中期后，皇权被消耗在北方蒙元和满清，不能压制海商财阀支持的官僚集团(如几任皇帝反复开海而被暗杀、如焚毁官方海图和造船档案、如剿灭戚家军和毛文龙以便东南海商与蒙元满清走私粮食铁器)，于是两宋开启、蒙元扩张、明初高潮的大航海红利，被东南海商联合倭寇西夷攫取…然后明清期的人类文明叙事，演变为西方人凿空发现美洲开启了大航海…

所以毛文龙到底取得了多大战果，？

用事实说话 毛文龙活着满清没入关 毛文龙死清军立马入关 袁崇焕算个卵，一辈子连辽河都没看见过！

如果换成工业革命后的海权时代，以东江镇的位置，从海上用坚船利炮可以把满清吊着打。

皮岛就是黑暗里一盏明灯。那些沦陷区和被撸过去给鞑子做牛马的百姓只要有机会就能抱块木板游到皮岛不再做狗。这让满清收服人心的企图破产。没了这个口子 沦陷在后方的辽民彻底没了希望只能甘心当二鞑子。到了残暴的努尔哈赤暴毙 更加英明的皇太极上台推出汉人立军功也能抬旗脱离奴籍的举措，这些没人要的汉人更是冲锋在前杀起自己人毫不手软，满清自己都不用动手，否则六万八旗要打下全中国早死光了。

1631年皮島海戰西洋炮共施放了十九次，加上三眼槍的配合射擊，擊斃後金兵約六七百人。雙方激戰十餘日，後金終究敵不過明軍的猛烈炮火和海上用船之不便，被迫放棄進攻，「畏縮奔於八十里之外，不敢復近海岸」。