主人公萧秋水长歌争气，义薄云天，喜结天下豪杰，不料所在浣花剑派一夜之间被权力帮和朱大天王两大江湖派系屠戮殆尽，正值北宋末年，奸臣当道，外族入侵，于是他从此踏上了为国为家之路。
　　机缘巧合，主人公食下武林第一人燕狂徒所留无极仙丹，又受各派八大高手倾囊所受，最后更是习得武林人梦寐以求的忘情天书，手执天下英雄令，召天下英雄组成神州结义，勇斗权力帮、朱大天王、燕狂徒，更是和岳飞联手抵御外族入侵，谱写出可歌可泣的篇章，里面还杂糅了他和唐门唐方一段爱恨纠缠，整个文章荡气回肠。
　　温瑞安后来写到：神州奇侠尽管是年轻时的作品，年长后虽阅历渐丰，文笔渐厚，却是自己无法超越的一部“天书”。
　　可见此书之奇。温瑞安也正是靠《神州奇侠》和《四大名捕》系列，稳坐中国武侠界第四把交椅。

正传故事简介： 剑锋寒，武道难，冷看苍天无语；儿女情，英雄乱，谁能天下无敌?
　　主角萧秋水之父萧西楼为保护民族英雄岳飞的母亲，结果被权力帮精英所围，萧西楼及萧家上下均力战而死。主角萧秋水，身负国恨家仇，毅然带领兄弟们创立神州结义，立誓瓦解权力帮，驱逐金兵，廓清中原。后经过一番可歌可泣的血战磨难，终于在当阳城成为武林盟主，随后转战各地，援助岳飞抗金。然而胜利在即，岳飞却被昏君奸臣十二道金牌召回。一到汴梁就被捕，身陷天牢。江湖义士纷纷去救，然而却死伤惨重，萧秋水毅然独闯天牢，在最后一层从秦桧座下高手口中得知，岳飞已被押至风波亭。而此时，神州结义的众豪杰，也开始攻打天牢......
　　萧秋水赶至风波亭，却亲眼见到两位同来救岳飞的知己被杀，痛不欲生，而勾结金国的朱大天王暗里偷袭重伤了萧秋水，危急时刻，三才剑客联手弹奏一曲《满江红》，使萧秋水振作，一招“日明”，击毙强敌。
　　但是在萧秋水赶赴风波亭的路上，昏君奸臣已在天牢杀害了岳飞。
　　而前去攻打天牢的结义兄弟邱南顾也不幸战死。
　　红颜知己唐方却被唐门唐老太太囚禁，不许她再见萧秋水。
　　连番遭受打击的萧秋水，心灰意冷，黯然离去......
　　在后传中，萧秋水为见唐方，独身闯唐门，经过七年生死磨难后，终于有情人终成眷属。
　　唐方一战讲述的是萧秋水的红颜知己唐方，在与萧秋水分别后所经历的人生变故。
　　血河车与正传已没有多大关系，主角是一代奇侠方歌吟，行侠仗义，除暴安良的故事。