故事以公元2060年为舞台，讲述当时一个被通称为“第九”；全名为“科学**研究所.法医第九研究室”的政府机关。其工作主要是负责从已死去的人们脑中提取出还活着时所见到的影像，从而使各种悬案得以破案。
被分配在这里工作的研究员青木一行，与拥有稀有的美貌和恐怖能力的“第九”室长薪刚一起，从被害者生前所看到的影像中寻找线索，从而追察出各类事件的真相。但是，直面死者的记忆，却带有难以想像的残酷性……
《秘密》的主题是探讨隐私、道德、法律三者难以平衡的关系，每个故事都很引人深思。在科幻、推理的包装底下，其实作者更着重刻划人与人之间的关系，与及人类复杂的感情世界。
这部作品是以描写通过‘死’将人的‘视觉’再现为起点的作品。——清水玲子