楼主想了想,讨论帖需要一个拉风的名字,ABP是楼主ID的缩写,头脑风暴则是楼主从第一贴开始希望能给大家带来的不受约束的思考。
这次比较长,请耐心阅读。
进入正题哈,酵母,就是做面包酿酒当中用到的主要菌种,具体百度上面有不少资料。它主要就是两种,S.p和S.c(请原谅楼主只记得缩写
),酵母双杂交一般用的是S.c,也就是酿酒酵母,它是什么个感觉呢,就是我们做酵母双杂交实验的时候,培养箱里面总是有一股自然的酒香和肉香~~这种酵母既可以无性繁殖,也可以有性繁殖(AH109+Y187等等)
酵母双杂交是用于鉴定蛋白质相互作用的,有一个LacZ(这个认识吧,乳糖操纵子当中的基因)的转录因子GAL4,GAL4它有两个结构域,BD和AD。BD是结合到DNA序列的结构域,AD是激活转录的结构域,BD和AD是没有相互作用的,当BD和AD同时存在时,LacZ的转录就会被激活。
所以人们就设计了,BD和蛋白质1融合,AD和蛋白质2融合,(通过营养缺陷筛选酵母是否表达BD或AD),如果蛋白质1和蛋白质2能相互作用,那么这个蛋白复合体由于同时含有BD和AD,就能激活LacZ的转录,而LacZ是可以通过类似于蓝白斑筛选,其阳性结果是蓝色的。于是乎人们找到了这一种鉴定蛋白质相互作用的办法。(pGBKT7,pGADT7,可百度到这两种图谱)
于是问题来了,
1、热身问题,BD和AD也是通过质粒进入酵母的,你怎么知道酵母表达了融合蛋白呢?
2、很明显,这里会出现假阳性和假阴性的结果,是由哪些原因造成的呢?
3、一般对照用的是,阳性p53-T抗原,阴性Lem-T抗原,但是这只是作用强弱的对照。如果要排除假阳性,需要设计什么样的对照?
4、结合-激活-报告,那么对于荧光蛋白,能不能设计一个方案,让它也能报告相互作用?
这是楼主奉献的周末头脑大餐,请愉快享用~

进入正题哈,酵母,就是做面包酿酒当中用到的主要菌种,具体百度上面有不少资料。它主要就是两种,S.p和S.c(请原谅楼主只记得缩写

酵母双杂交是用于鉴定蛋白质相互作用的,有一个LacZ(这个认识吧,乳糖操纵子当中的基因)的转录因子GAL4,GAL4它有两个结构域,BD和AD。BD是结合到DNA序列的结构域,AD是激活转录的结构域,BD和AD是没有相互作用的,当BD和AD同时存在时,LacZ的转录就会被激活。
所以人们就设计了,BD和蛋白质1融合,AD和蛋白质2融合,(通过营养缺陷筛选酵母是否表达BD或AD),如果蛋白质1和蛋白质2能相互作用,那么这个蛋白复合体由于同时含有BD和AD,就能激活LacZ的转录,而LacZ是可以通过类似于蓝白斑筛选,其阳性结果是蓝色的。于是乎人们找到了这一种鉴定蛋白质相互作用的办法。(pGBKT7,pGADT7,可百度到这两种图谱)
于是问题来了,
1、热身问题,BD和AD也是通过质粒进入酵母的,你怎么知道酵母表达了融合蛋白呢?
2、很明显,这里会出现假阳性和假阴性的结果,是由哪些原因造成的呢?
3、一般对照用的是,阳性p53-T抗原,阴性Lem-T抗原,但是这只是作用强弱的对照。如果要排除假阳性,需要设计什么样的对照?
4、结合-激活-报告,那么对于荧光蛋白,能不能设计一个方案,让它也能报告相互作用?
这是楼主奉献的周末头脑大餐,请愉快享用~
