腐败食品微生物是由于太长时间放置，引起食品发生化学或物理性质变化，从而使食品失去原有的营养价值、组织性状及色、香、味，成为不符合食品卫生要求的微生物。是食品微生物（发酵食品微生物、食品腐败微生物、食物中毒微生物）主要内容之一。植物性和动物性食品原料在收获、运输、加工和贮藏过程中时间太长，会受到微生物的污染。由于食品性质、来源和加工处理不同,引起食品腐败的微生物也各有差异。通常细菌、霉菌、酵母都能引起食品腐败以细菌和霉菌引起的食品腐败最为常见，食品的腐败也是一种缓慢氧化。