比丘尼塔林由精美的石刻垒起来的塔林，为妙高寺下领之鹿鸣庵的历代比丘尼的墓塔。其塔的风格有异于中原佛教寺院墓塔。从塔的造型和塔身的浮雕图案探讨，至少是隋唐建成，且与藏传佛塔相似，为考证寺院历史提供了重要依据。一通重要的塔铭上有“十方僧尼二普同塔”，为清乾隆年间所立。僧尼合寺已为奇观，而僧尼同塔更为佛门弟子所罕见，凸显了妙高寺包容厚重的佛教文化。