作为药用，黑豆主要有４大功效：
一是滋补脾肾。脾为后天之本，肾为先天之本，补脾肾就是补先天之本和后天之本，故有抗老延年益寿之功。
二是祛风邪。中医所说的“风”，并不是指现代人理解的“流动的空气”。在《本草纲目》中，有关黑豆祛风的应用，就包括单用黑豆煎汁服，治疗中风 ，头风头痛，破伤中风，颈项强硬，暴得风疾，风入脏中，风毒攻心，卒风不语，喉痹不语，卒然失音，卒然中恶以及风痹、瘫痪、口噤、产后痉风等，这些病都具有“风”的征象，也都属于“风病”的范畴。
三是活血利水。明代李时珍指出：“黑豆治肾病，利水下气，活血。”也就是说，对于水肿胀满、浮肿、小便淋痛等也都可用黑豆来治疗。
四是解诸毒。古代不少医药文献都有黑豆解百毒的记载，包括“杀乌头毒”（《别录》），解“酒食诸毒”（《肘后方》），“解砒石、甘遂、天雄、附子、射罔、巴豆、芫青、斑蝥、百药之毒”（《本草纲目》），“善解五金、八石、百草诸毒及虫毒”（《本草汇言》）等。关于黑豆解百毒，明代大药学家李时珍的体会是：“予每试之，大不然，又加甘草，其验乃奇，如此之事，不可不知。”
古代养生家应用黑豆养生抗老和益寿延年，的确是有实践和记载的。唐代103岁的名医兼养生家甄权就曾介绍：“每食后咀磨吞三十粒，令人长生，初服时身似重，一年以后便觉身轻，有益阳道。”古代汪颖也认为：“以黑豆入盐煮，常时食之，能补肾。豆乃肾之谷，其形类肾而又黑色通肾，引之以盐，所以妙也。”在宋代陈直《奉亲养老书》中曾有记载：“李守愚每晨水吞黑豆二七枚，谓之五脏谷，到老不衰。”在《延年秘录》中还推荐人们服食大豆来养生，能“令人长肌肤，益颜色，填骨髓，加气力，补虚能食。”由此看来，如果不从营养学的营养成分考虑，而从中医养生角度分析，则黑豆不仅具有黄大豆所缺乏的药用功效，而且养生功效也比黄豆要优越得多。所以，有兴趣的养生爱好者，不妨单用黑豆1千克，淘洗后拌入细盐30克，放入锅内隔水蒸透晒干，反复3次，装入瓶内，每日早晨空腹吞食14粒，只要长期坚持下去，确有补肾抗衰老和益寿延年的效果。