序章
凯恩及其信徒离开后，在GDI的帮助下，世界各国重新恢复了对其领土的控制权。随着泰伯利亚的消失，各国都将大量的资金投入到重建工作中，而GDI则负责维持各国的秩序。
2081年 德国 某实验室
GDI的数名高级军官正在看着瑞奇托芬博士和他的助手们对传送机进行最后的检查
军官1：“还没结束？”
瑞奇托芬博士：“等等……好了，可以了。”
军官2：“现在就开始吧。”
瑞奇托芬向助手们点了一下头，助手们离开了机器，并进入各自的岗位。博士将一块石头放进传送机正中间，然后离开传送机，说了一声“开始”，一名助手打开开关，传送机开始运作。
“不出意外的话，三秒后，这块石头将被送到指定地点。”博士向军官们解说道，“我的助手在那等着，成功了他会通知我们的。”他的声音有些颤抖，为了这一刻，他和他的团队准备了好几年。
就在这时，另一名助手大声地叫道：“博士，读数出现异常。”博士冲到控制台边：“怎么……”话还没说完，实验室的灯开始忽明忽暗，然后灭了。传送机发出刺眼的光芒，所有人不得不用闭上眼睛，只听见“peng”的一声，机器停止运作，电灯恢复正常，当人们把眼睛睁开时，发现传送机中石头还在，却出现了一个手提袋子的年轻人和一个老人。
“您是……爱因斯坦博士？”博士的声音打破了沉寂。
“指挥官482报道。”
“知道为什么把你从前线召回来吗？”
“……不知道。”
“你的现在的任务是攻下地球，消灭所有当地生物。原住民的数据收到了吗？”
“是的。”
“入侵部队的指挥权已经移交给你了，你们将在1400个时间周期内抵达地球，另外，这个给你，用于夺回结界塔的控制权。”
“明白。”
“还有一件事，返回飞船后立即格式化你的AI。”
文笔不好，序章是赶工出来的，正片要等很久，另外
"这个坑比大神宫的那个还大唉"——GDI士兵