1、《士与中国文化》（上海人民出版社）
2、《朱熹的历史世界》（生活·读书·新知三联书店）
3、《现代危机与思想人物》（生活·读书·新知三联书店）
4、《文史传统与文化重建》（生活·读书·新知三联书店）
5、《现代儒学的回顾与展望》（生活·读书·新知三联书店）
6、《方以智晚节考》（生活·读书·新知三联书店）
7、《论戴震与章学诚》（生活·读书·新知三联书店）
8、《人文与理性的中国》（上海古籍出版社）
9、《汉代贸易与扩张》（上海古籍出版社）
10、《东汉生死观》（上海古籍出版社）
11、《十字路口的中国史学》（上海古籍出版社）
12、《史学研究经验谈》（上海文艺出版社）
13、《红楼梦的两个世界》（上海社会科学院出版社）
14、《余英时访谈录》（中华书局）
15、《论天人之际》（中华书局）
16、《钱穆与现代中国学术》（广西师范大学出版社）
17、《历史与思想》（聯經出版公司）
18、《重寻胡适历程》（广师范、上海三联）
19、《中国文化的重建》（中信出版社）
20、《师友记往：余英时怀旧集》（北京大学出版社）
21、《学思答问：余英时访谈集》（北京大学出版社）
22、《卮言自纪：余英时自序集》（北京大学出版社）
23、《中国情怀：余英时散文集》（北京大学出版社）
24、《中国思想传统的现代诠释》（江苏人民出版社）
25、《中国文化史通释》（生活·读书·新知三联书店）
26、《陈寅恪晚年诗文释证》（東大圖書股份有限公司）
27、《余英时学术思想文选》(上海古籍出版社)
28、《论士衡史》(上海文艺出版社)
29、《未尽的才情》(聯經出版公司)
30、《历史人物与文化危机》(三民書局)
31、《会友集》（三民書局）
32、《宋明理学与政治文化》（吉林出版集团）
33、《现代儒学论》（上海人民出版社）
34、《中国知识分子论》（河南人民出版社）
35、《犹记风吹水上鳞》（三民書局股份有限公司）
36、《中国近世宗教伦理与商人精神》（九州出版社）
37、《人文与民主》（時報文化出版企業股份）
38、《中国知识阶层史论（古代篇）》（聯經出版事業股份有限公司）
39、《史学与传统》（時報文化）
40、《中国历史转型时期的知识分子》（聯經出版公司）
41、《余英时文集十二卷》（广西师范大学出版社）