第一章，重回卡洛滋
小智一行人正在阿罗拉地方上课，忽然，天空出现了一个洞，紧接着就是99999级，是普通炮弹的99999倍大的炮弹飞来，整个阿罗拉地方被炸的只剩机场了。小智他们刚好到机场，就被炸懵了。这时，库库伊博士对小智说“快走，阿罗拉要沉了！”大家把小智送上了飞机，正好飞往卡洛滋。于是，小智就去了卡洛滋地方。
小智大声喊道：“卡洛滋地方，真新镇的小智又来了！”“皮卡皮卡！”皮卡丘也很高兴。结果，小智又摔下了飞机，“这飞机是不是和我有啊？”“皮卡”皮卡丘流了一滴汗。突然，一个念头闪过小智的心。小智对皮卡丘说“走，我们去森林。”“皮卡皮卡。”皮卡丘明白了小智的意思，和小智一起向森林跑去……

第二章，找到甲贺忍蛙
小智和皮卡丘向森林跑去，这时，小智的面前长出了一个负能量树腾，“皮卡丘，用铁尾！”“皮卡皮卡！”唰的一下，树藤断了。在小智的旁边又刷了三个树藤。“皮卡丘，用十万伏特！”
“皮卡皮卡，皮卡丘！”三根树藤也断了。结果又刷了五根树藤，小智握紧了拳头，“可恶，好烦呐！皮卡丘，这就是我们的全力一击，终极伏特狂雷闪！”“皮卡丘！”轰！负能量全没了。突然，小智脚下蹦出了一个负能量，把小智缠住了。“可恶，难道我就要在这丧命吗？”森林深处飞出了一个手里剑，小智和皮卡丘得救了。“甲贺忍蛙！”“jiula”……

好吧