第一章 首先开始说的是故事的舞台是一个临海的地方都市“弓张市”，被自然和乡土气息包覆的这片土地同时也是孕育艺术家的庭院
在故事开始的这一年恰逢樱花盛开的季节，曾经创作了世界名画“卧樱”的世界著名画家——草薙键一郎在这里与世长辞。键一郎的儿子也就是本作的主人公草薙直哉虽然因故放弃了父亲遗留的价值15亿日元的遗产，但是在同伴的帮助和关怀之下也过着没有不便的生活。
直哉仿佛继承了父亲的卓越才能一般，自幼就在绘画方面展现出了卓越的才能。虽然如今还只是一个高中生，但他的作品已经打动了很多人，其中自然包括他的小伙伴们，但是自从过去的某一个时刻开始，他就开始不再绘画不管周围人怎么询问他都一直缄口不语。
他的好基友夏目圭自小就憧憬着直哉的画而跟随着他迈进了绘画的世界，现在他也仍然希望可以像以前一样跟着直哉一起画画，成为能够超越草薙键一郎的画家，尽管直哉对于圭也有难言之隐，但是从某种程度的意义上圭就是直哉的最好理解者，不仅是圭，草薙家和夏目家很早之前就是至交，圭的姐姐夏目蓝目前就在直哉等人就读的弓张学院担任教师和美术部顾问，她对于直哉来说也是一个关系亲密而且十分照顾他的大姐姐。

圭和蓝

安顿完了父亲的葬礼之后直哉家由于地板掺水必须修理而无法居住，在夏目蓝(之后简称蓝）的盛情邀请之下，直哉就暂时住进了夏目家的宅子，这时他也见到了目前以草薙葛佳的名义在演艺圈活跃的夏目家次女夏目雫吗，她虽然拥有三无冷面美少女的气质但是和直哉相处的时候关系也很亲昵。
在不久之后新学期开学，直哉所在的的班级迎来了转学生，那竟然是直哉六年级前就搬离了弓张的青梅竹马——御樱禀。禀在很小时候就经常和直哉在一起玩，两个人的关系曾经很亲密，但是在她搬离弓张之后不管禀怎么写信想和直哉联系，直哉都一直没有回应，如今的重逢，让禀再次回到了直哉的生活之中。
此时直哉的学校生活是以美术部为中心的，但是他自己却并不是美术部的成员。新学期开始现任美术部部长——鸟谷真琴开始了新一轮的招新，自称是直哉“妹妹”的学妹冰川里奈和对美术产生兴趣的学妹川内野优美加入了美术部，算上圭和禀，美术部的人数也是增加了不少，但禀作为一个好奇的小天使对于直哉已经不是美术部成员产生了疑惑，这个时候她知道直哉已经不再画画了。为此十分惊讶的禀和直哉产生了冲突，在剑拔弩张的时候被部长真琴的劝说下直哉担任起教禀画画的职责，事情才总算是稳定了下来。

雫，禀和学妹

但是美术部的风波才是刚刚开始，随后，后面的两大问题儿童引起的骚动险些让美术部遭到废弃的处分。首先是美术部迎来了一个来自法国的交换生马克思（不是我故意的人家译名过来真的就是这玩意......），这个来自异邦的天才（作死小能手）的艺术理念似乎和众人的观念格格不入，对于人体艺术相关的领域格外执着，果然不久就马上发生骚动。众人原计划好的素描大会，因为马克思的精心策划再配合他制作的水融性服装，要不是直哉提前发现差点就变成了裸体素描大会。好在前任部长明石亘（简称大雄）和学生会双胞胎小夫胖虎的及时登场才制止了这一场骚动，并且万幸借由学生会长胖虎和小夫的交情才免去了美术部大部分责任，大雄也避免了退学的危机，但是真琴由于马克思对于艺术异于常人的理解和强大的主观性动能，不顾众人反对还是将马克思留在了美术部。

现任部长真琴和马克思（被打的那个）

然后美术部迎来了第二个更为严重的问题，美术部的前任部长明石亘..哦不，是大雄最近的行迹特别可疑，众人发现大雄有偷偷挪用社团经费的嫌疑，经过逼问和调查，直哉得知大雄不知为何购买了大量的室内拖鞋和丙酮等有机溶液，大雄本人的意愿只是图转手赚一笔，但直哉和现任部长美琴总觉得这件事情没那么简单。直到夏天来临暑假开始，美术部众人准备合宿的时候，大雄的计划才渐渐浮出水面。
这所学校教堂里长年任职的神父不幸病倒，境遇很不好，为了治病必须接受手术，一直以来神父一直很照顾大雄和他的两个妹妹，刚刚好这个时间段教堂准备进行翻新，大雄为了报恩想为神父做点什么，他想尽办法得到了教会的改装设计图，但是这张设计图居然是以前直哉父亲，草薙键一郎所绘制的设计图。合宿前天，大雄终于开始了行动，但是根据调查得知真相的直哉早早就在教会面前等着他，无奈之下大雄只得交代自己是被直哉父亲键一郎的设计图所震撼，想要完成这幅未完的力作，为了能让神父在手术之前看到完成的作品，只能赶在现在行动，而他之前购入的各色室内鞋和有机溶剂正是制作壁画所需要的染料。

由于计划败露大雄无奈之下只能让直哉帮忙，但是由于工作量实在是过于巨大，就算是加上之前偶然结识的神秘少女“吹”的帮忙也很难赶上进度，关键时候万能的部长真琴站出来表示你是窝看中滴男人偶一定要帮你带着本应该前往合宿地点的美术部小伙伴一同来帮忙，在大家的共同努力下勉强在天亮前完成了壁画，随后成为了弓张市的艺术文化象征，受到了当地居民喜爱的名作——“樱花们的足迹”

随即壁画引起的巨大骚动，学校为了考虑草薙键一郎的作品名声和其他各方面的议论，身为部长真琴母亲的校长表示既然是我女儿看上滴男人就给我争气点站出来的要求直哉往外界声明这个是由直哉独自指导完成的父亲的遗作，不然就全员同学处理，直哉认为这个是对于大雄努力的侮辱断然拒绝。
但是之后大雄愤怒的出来男人的对直哉表示了一把：“作品不是为了名声和关注，你对于作品所谓的目的和意义一无所知，要是你连这个都了解不了那你就是一个不入流的艺术家”

直哉之后虽然并未完全理解和接受大雄这番话，但是还是尊从了大雄的意愿接受了校长的计划，承认了自己是主谋。随后失去了合宿机会的美术部的小伙伴们忙里偷闲的在学校的在学校泳池里一起欣赏夏季祭典的烟花，结束了这个夏天
共同线就此结束，接下来分章描写各个角色的个人线

由于各种三次元繁忙的原因以及时间安排的问题，接下来的更新计划尽量为每天七点更新一线，重点的禀线和真结局最后才会揭晓，这两个章节也是本作的核心和意义所在，如果前期揭露太多这作也不会被称作业界之最了（笑）

纯洁无瑕的柏树与樱
冰川里奈&山内野优美

这条路线大部分是以里奈的好朋友优美的视角所展开的
首先从优美的回忆开始：优美认为自己所喜欢同性是与生俱来的本性，回想自己年幼时期见到里奈的瞬间，优美的直觉就告诉自己已经喜欢上了对方。当时优美即使年幼但已经有了自己的伦理异于常人的这一认识，因此主动避开了里奈，然而某天身为女孩子中心的里奈却对身为男孩子中心的的优美施与了微笑优美从那微笑中感到一丝不详的气息的同时也深深的陷入其中无法自拔。
后来某个夜晚，成为了不良少女的优美在公园闲逛时，一缕白色映入了她的眼帘。近一看发现原来是躲在废弃的的游乐设施中画画的里奈。里奈一改在班上八面玲珑的可爱劲儿，说话冷冰冰的，被这样的她所勾起兴趣的优美就这样与里奈聊了起来。两个人就这样频繁的在夜晚的公园里面会面。里奈一直在圆顶设施内画着象征着死亡的柏树，从谈论的话语和生活的细节，优美很快就察觉到了里奈身患癌症的事实。尽管如此，优美还是宛如被毒品吸引一般不知不觉的喜欢上这份死亡气息所持有的美。

本来只属于两个人的夜晚时光很快就被打断了，某一天一名少年闯进了她们的小小世界，少年擅自在里奈原本的画作上进行修改，而通过这位少年的画，里奈仿佛逐渐褪去了死亡的气息，开始萌发出生命力，接下来的日子里，里奈开始和这位少年交互作画，最终在一个暴风雨即将来临的夜里，少年将里奈所创造的漆黑的仿佛象征着生命终结的柏木，描绘成了一副无比繁盛的樱花图，里奈也露出了对优美和任何人来说从未展现过的灿烂的笑容。

在里奈来看，少年献上的这幅画作，仿佛在对她诉说着不要惧怕病魔，也给予了她接受手术的勇气——而这个少年不用我说了大家也猜到了这就是本作的主人公直哉，被画作感动的里奈要求直哉收他为徒却惨遭拒绝，于是这位机智的小姑娘就要挟直哉不收她为徒就自称是他妹妹（当时就把我们可爱的优美同学吓坏了），这种奇怪的要挟方式就让他成为了众所周知的“自称妹妹”。
随着时间流逝，一直作为孩子王站在打架实力顶点的优美也因为男女之间的生长差异，渐渐地退出群体。
时间回到现在，一天，优美在天台碰到了直哉，她主动聊起了直哉最后公开的作品——《樱日狂想》。那是直哉在母亲逝去之后创作的，至今最有名的作品。至今挂在市政府深受大家的喜爱。而在他们两人谈话之间优美联系到幼儿时对于当初在公园时作画的记忆，以及《春日狂想》的标题来源——即中原中也的“春日狂想”，她察觉到了一个事实，直哉是把自己右手最后的生命奉献给了里奈。（这里右手为什么会无法画画之后的路线会解释）

与此同时另一方面，不知道从什么时候起，里奈开始做着同一个梦，梦里的她以别名伯奇的少女为视角，伯奇平时以吞噬别人的梦境为食，梦中还出现了一个名叫中村义贞的少年，开始不断的与伯奇进行接触。里奈对于连接不断的梦感觉到十分好奇，并且认识到梦中的伯奇一定与镇上的伯奇神社有关，于是以后每次梦醒都会和优美来到校门后的伯奇神社去调查，在几经周折之后才知道优美一直在做着同样的梦不同的是里奈所扮演的是伯奇，而优美却是中村义贞。在梦中，优美看到伯奇正在逐渐失去吞噬梦的力量。
之后的日子里面里奈和直哉两人独处的机会日益增多，直哉也意识到了自己的感情变化，并且对里奈直接进行了表白，而开始因为没有自信而胆怯到不敢回应的里奈也在直哉的青梅竹马禀的推动下变得敢于正视自己的感情接受了直哉。

随着这边故事的展开，里奈的梦也迎来了尽头，本应作为食梦工具的伯奇（里奈），因为和中村义贞（优美）的频繁接触而获得了心以至于被驱魔师所驱逐，中村义贞得知后带着伯奇企图私奔，然而最终不敌追兵倒在血泊之中，悲伤至极的伯奇将之前所吞噬的梦一涌而出，梦化作雨从天而降，最终化作千年之樱而盛开。