1943年9月8日巴多里奥政府宣布同盟军“停战”后，正如国家的分裂一样，意大利空军也一分为二，但这两部分在许多方面却十分相似。确实，似乎只有她们各自飞机上的国家标志不同而已——南方空军用的是法西斯当权以前的三色同心圆形，而北方则用法西斯符号。
　　两支空军都继承了共同的历史遗产，有着共同的英雄——譬如，两边都有以一战头号王牌弗朗切斯科·巴拉卡为名的空军单位！还有，如1943年9月前的皇家空军一样，两边的飞行员和地勤人员都继续以可怜的装备及有限的后勤支援进行战斗。
在“停战”之际，由于英美空军的持续的压力，意大利空军剩余的大部分力量都集中在亚平宁半岛的中部和北部地区的基地。当“停战”一宣布，这样的地理分布使德军很容易地俘获了许多意大利飞机。在南方的许多空军由于缺乏任何装备而面临解散。
　　在北方，10月，空军副部长〔Sottosegretario all'Aviazione〕埃内斯托·波托〔Ernesto Botto〕中校和在意大利的德国空军〔第2航空队〕司令沃尔弗拉姆·冯·里希特霍芬元帅达成协议，建立一个临时的空军的核心。朱塞佩·拜隆〔Giuseppe Baylon〕中校成为空军部的代理部长，波托将新的空军命名为“共和国空军”〔Aeronautica Repubblicana〕，1944年6月又加上“国家”〔Nazionale〕。
　　新的空中力量面临的许多问题中最大的一个是如何处理与德国盟军的别扭的关系，后者仅把他们当做是提供劳力和资源的处于从属地位的伙伴。举一个例子，正当“共和国国家空军”努力组成并装备其独立的作战单位时，德军却征用了超过1000架的各类飞机。
这种窘境只是到了1943年底才得到改善，德国JG.77归还了一些马基C.205V，使第1战斗机大队得以成军。该单位的首次空战是1944年1月3日在都灵上空。
要点防御成为“共和国国家空军”的主要任务，第二支成立的部队是“蒙台富斯科”补充中队，装备菲亚特G.55战斗机，接着是4月成军的第2战斗机大队。当意大利制战斗机的供应不继后，这些单位转而装备1944年中由德国JG.53和JG.77提交的Bf-109G。在此之前的4月底，第1战斗机大队从坎波福尔米多〔Campoformido〕转至雷焦·艾米里亚，6月底又移至维琴察的蒂埃内〔Thiene〕。此时第2战斗机大队也从米兰布雷索〔Bresso〕转至博洛尼亚，又转至阿维亚诺〔Aviano〕进行Bf-109的转换训练，完成后部署到在自由镇〔Villafranca〕的新基地
北方德国控制下的空军称为“共和国国家空军〔ANR〕”，在努力争取独立地位的同时，采用了德国空军的模式。“共和国国家空军”中纳入了伞兵和防空炮兵，并采用德国的战术编队〔双机/四机编队〕以及雷达引导和改进了的空对空射击训练。还有，“共和国国家空军”沿用德国空军的大队样式重组了战斗机大队〔Gruppi Caccia〕，下辖3个战斗机中队和1个地勤中队。每个中队〔Squadriglie〕的战斗机数量增加到15—20架，与德国空军的中队〔Staffel〕相同，而原来的意大利皇家空军每中队平均仅有10—12架。鱼雷轰炸机和运输机部队也根据能够得到的飞机数量得到重建。

西班牙内战时的战斗机英雄埃内斯托·波托〔Ernesto Botto〕中校被任命为空军部次长，此举非常有利于吸引在“停战”后已经解散的前皇家意大利空军人员〔尤其是战斗机单位的〕重归“共和国国家空军”旗下。空军人员对于德国傀儡RSI的忠诚很有限，参加“共和国国家空军”多半是由于冲动而非理性。但这种冲动和狂热却使“共和国国家空军”能够在德国的强大政治压力下保持独立，而陆军和海军都屈服了。结果，“共和国国家空军”是唯一正常运作的RSI武装力量，在对英美作战中取得战绩，并得到德军乃至意大利游击队的尊重。抵抗力量认识到“共和国国家空军”在保护意大利人民免遭美军猛烈轰炸方面的作用，经常与“共和国国家空军”在所在地的单位签订互不侵犯协定。
“停战”甫一宣布，拒绝服从调转枪口的空军人员就开始重组新的作战单位。在罗马成立了一支由泰萨里〔Tessari〕将军、东迪〔Tondi〕上校、卡斯泰拉尼〔Castellani〕上校领导的部队。另一支由法尔科尼〔Falconi〕上校领导的主要由战斗机飞行员组成的部队也成立了。在“停战”后的混乱中，还有许多个人的行为。比如，阿德里亚诺·维斯孔蒂〔Adriano Visconti〕少校〔后来成为第1战斗机大队大队长〕率领一小队马基C.205V飞往罗马附近的圭多尼亚机场以躲避德军对撒丁岛意大利机场的包围，3架飞机居然塞进了8名地勤加上3名飞行员。
10月12日，波托中校发表了一个公告，成功吸引了许多飞行员来到北部的各机场。15日又根据部队类型分别设立了报到中心来集中飞行人员和飞机。米兰的布雷索〔Bresso〕机场成为战斗机和侦察机部队的报到中心，瓦雷泽〔Varese〕的维内格诺〔Venegono〕机场则收集鱼雷轰炸机部队，水上飞机汇集到塞斯托·卡兰代〔Sesto Calende〕，运输机飞往贝尔加莫。
第101独立战斗机大队是停战后几周内最早自发建立的单位之一。在佛罗伦萨成立，1944年初转往都灵附近的米拉菲奥里〔Mirafiori〕，但后来因飞机短缺而撤消。1944年4月，该单位部分人员与其大队长米凯利〔Micheli〕少校前往德国，进行Bf-109战斗机的转换训练，完成后部分飞行员于1944年8月加入第2战斗机大队。
　　另一支自发建立的单位是1943年末在都灵附近的维纳里亚·里阿雷〔Venaria Reale〕成立的“蒙台富斯科”补充中队〔Complementare Caccia 'Montefusco'〕，装备菲亚特G.55和马基C.205。
收集飞机和人员的最重要的成果是第一战斗机大队于1943年11月15日成立，官方的正式日期是1944年1月1日。在1943年11月和12月，该大队在博尔戈尼奥〔Borgogno〕少校的指挥下，在瓦雷泽附近的洛纳台·波佐洛〔Lonate Pozzolo〕接收了一批马基C.205。许多该型战斗机在“停战”后被德国空军的JG.77没收和使用。12月，第1战斗机大队分为3个中队并转往库内奥〔Cuneo〕附近的拉尼亚斯科〔Lagnasco〕，学习德国战斗机战术并接收仍在德军手里的剩余C.205。
同时，“共和国国家空军”开始组建鱼雷轰炸机部队。“停战”后，法吉奥尼〔Faggioni〕上尉，一名勇敢的前鱼雷轰炸机飞行员，在佛罗伦萨收集了10来架萨伏亚·马尔凯蒂S.79三发鱼雷轰炸机及其乘员组。
10月26日到12月初，彻底检修了飞机后，转往维内格诺，在那儿，SIAI公司又制造了一批12架改进的S.79。较旧的飞机被提升至新的标准。在11月15日的转场飞行中，在皮亚琴察附近损失了1架S.79，2名机员成为“共和国国家空军”最早的伤亡人员。该单位被命名为“布斯卡里亚”独立鱼雷轰炸机大队〔金质军事勇气奖章获得者卡罗·布斯卡里亚「Carlo Buscaglia」是意大利空军的鱼雷轰炸机王牌，当时认为在1942年11月对阿尔及利亚的布尔日的袭击中失踪，实际上被俘并加入南方同盟空军〕，11月14日，法吉奥尼领导的该部队开始战斗活动，其3个中队也开始了最后的训练。
第1“泰拉齐亚诺”〔Terracciano〕运输机大队于1943年11月在贝尔加莫附近的奥里奥·阿尔·塞里奥〔Orio al Serio〕机场成立。以佩里萨里〔Pellizzari〕少校为大队长的该单位聚集了原空军的许多轰炸机和运输机部队〔这些单位遭受了比其他单位更重的损失〕的老兵。“泰拉齐亚诺”大队成立时没有1架飞机，因为德军许诺交回的SIAI·马尔凯蒂S.81飞机仍然在被德军使用。然后由于RSI的国土狭小，对运输机的需求有限，因此决定将其用于东线德第6航空队的后勤支援。1944年1月21日，“泰拉齐亚诺”大队的人员乘火车前往戈斯拉尔〔Goslar，在德国〕，德军扣留的S.81都在那儿。1月23日，该大队接收了24架S.81，又从意大利得到了另10架S.81。

1944年1月1日，共成立了以下的单位：
第1战斗机大队－马基C.205；“蒙台富斯科”补充中队　　　　　　－马基C.205，菲亚特G.55；第1“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队－萨伏亚·马尔凯蒂S.79；鱼雷轰炸机训练支队－萨伏亚·马尔凯蒂S.79；　第1“泰拉齐亚诺”运输机大队－萨伏亚·马尔凯蒂S.81；空军次长联络机支队〔Reparto Aerocollegamento Sottosegretariato〕－各种型号飞机。
空军次长联络机支队于1943年12月成立于米兰的布雷索机场，由RSI的空军副部长办公室直接控制。以夸特罗齐奥齐〔Quattrociocchi〕少校指挥的该部队使用各种型号的飞机，一直到战争结束。其众多任务中包括RSI政府的联络飞行，人员运输及修理受损飞机。
RSI空军中战斗机和鱼雷机单位占了很大成分，这不仅是出于实际情况的考虑〔即响应波托召唤的大多是战斗机或鱼雷机部队的人员〕，还反映出RSI的防御的姿态，即避免在被盟军占领的意大利领土上使用空军，南方的空军也基本如此。
尽管资源迅速用尽，“共和国国家空军”开始时的作战能力比南方同盟空军强得多。意大利几乎全部的航空工业都集中在北方。另外，由于盟军的战略，马基、菲亚特、SIAI·马尔凯蒂的工厂到1944年为止只受到少量的轰炸破坏。因此，1943年底，新的批次的马基C.205和菲亚特G.55战斗机和萨伏亚·马尔凯蒂S.79鱼雷轰炸机加入了“共和国国家空军”，加上德军归还的飞机。稳定的飞机供应使“共和国国家空军”到1944年中为止保持了较高的战备水平，并在此后继续存在于意大利北方的天空中。德军发现装备完善训练提高的“共和国国家空军”已经是一支高度有效的空中武力，遂撤出了其战斗机部队用于德本土的防御。
尽管是一场从开始就胜负已分的战斗，但“共和国国家空军”还是存在了16个月，许多人阵亡——鲜有为了某种政治理念——而只是为了他们自己、他们的家人、他们的土地、他们的同志、他们的荣誉——所有这些都赢得了敌对双方的尊重。

“共和国国家空军”的编成：
空军总部：
鱼雷轰炸机司令部、战斗机司令部、运输机司令部、防空炮兵司令部、空军学院〔“黄道带”Zodiaco和“鹰2”课程〕、战斗机训练小队、5个新兵营、9个反空降营；“弗格雷尔”〔“闪电”〕伞兵突击团〔Folgore Reggimento Arditi Paracadutisti〕：第1“闪电”、第2“雨云”〔Nembo〕、第三“天蓝”〔Azzurro〕伞兵营；
第1战斗机大队：第1“拉里斯蒙特”〔Larismont〕〔拉里斯蒙特为意大利空军英雄，下面各中队名字也一样以空军王牌命名〕、第2“基多·波巴”〔Guido Bobba〕、第3“当泰·奥卡索”〔Dante Ocarso〕战斗机中队；
第2战斗机大队：第1“基吉·卡内佩雷”〔Gigi Caneppelle〕，又名“树与小鸟”〔Gigi Tre Osei〕、第2“尼科拉·马加尔迪”〔Nicola Magaldi〕、第3“吉安尼·格拉费尔”〔Gianni Graffer〕战斗机中队；
第3战斗机大队：第101独立战斗机大队、“蒙台富斯科”补充战斗机中队、“弗朗切斯科·巴拉卡”训练中队；
第1“法吉奥尼〔布斯卡里亚〕”鱼雷轰炸机大队、第1“泰拉齐亚诺”运输机大队、第2“特拉布齐”〔Trabucchi〕运输机大队、空军次长联络机支队、第1“埃托雷·穆蒂”〔Ettore Muti〕轰炸机中队、滑翔机中队。
除了上述的正式中队名字，各中队还有其昵称，这些昵称来源于各自机上的标志。如第1战斗机大队第1中队“棍棒王牌”〔Asso di Bastoni，意大利扑克牌中的一张，图案不同于流行的“国际”样式〕；第2中队“发怒的黄蜂”〔Vespa Incacchiata〕；第3中队“搭箭，张弓，放箭”〔Incocca, tende, scaglia〕。第2战斗机大队第1中队“树与小鸟”〔Gigi tre Osei ，基吉和3只小鸟，王牌基吉·卡内佩雷战前是顶级的滑翔机飞行员——可以佩带绘有3只白色小鸟的蓝色臂章〕；第2中队“红色魔鬼”〔Diavoli Rossi〕；第3中队“钢腿”〔Gamba di Ferro，波托上尉的绰号，最有魅力的二战意大利飞行员之一，在西班牙内战中失去一条腿，装上义肢，遂得名〕。

“树与小鸟”

“红色魔鬼”

“发怒的黄蜂”

“钢腿”

“搭箭，张弓，放箭”

最初的战斗
　　作战行动开始于1944年1月3日，10架第1战斗机大队的马基C.205从拉尼亚斯科〔Lagnasco〕紧急起飞，拦截一队B-17“飞行堡垒”和护航的P-38“闪电”战斗机。第1战斗机大队声称击落3架敌机，分别由维斯孔蒂上尉、鲁伽里〔Lugari〕少尉和库斯库纳〔Cuscuna〕军士长取得。这是“共和国国家空军”的最早的战绩。
1月12—24日间，第1战斗机大队由拉尼亚斯科转至乌迪内附近的坎波福尔米多，与德空军的第77战斗机联队〔JG77〕一起，对付美第15航空队〔15th Air Force〕的轰炸机。到28日，第1大队的13架马基C.205声称击落2架轰炸机，但3天后该部在声称击落2架B-24“解放者”和3架P-47“雷电”的同时，也损失了3架战斗机。接着是与德国空军JG.77的共同行动，有时出动百架德意飞机。如此大规模的战斗机行动产生了许多问题，再加上语言问题，使白热化的空战中的协同非常困难。从1月31日到2月23日共执行了6次战斗任务，在最后一次中，博尔戈尼奥〔Borgogno〕少校在遭1架Bf-109错误攻击并击伤后被迫跳伞，维斯孔蒂上尉接替他成为第1战斗机大队大队长。
　　与此同时，发生了两件重要的事：第2战斗机大队于1944年2、3月间在布雷索成立；“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队开始执行战斗任务。
ANR的第2个战斗机大队——第2战斗机大队于1943年底被批准，主要由原空军的第3和第150独立战斗机大队的许多老手组成，1943年4—7月，当时面临盟军对西西里的大规模入侵的这些单位都换装了Bf-109战斗机。第2战斗机大队最初由维佐托〔Vizzotto〕中校指挥，后由阿莱桑德里尼〔Alessandrini〕中校接任。该大队有3个中队和1个由高级军官和大队指挥官组成的指挥中心〔Nucleo Comando〕。3月初，第2大队在布雷索接收了40架菲亚特G.55战斗机后开始作战训练。
以戈里齐亚为基地，“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队于3月初开始作战行动，受命攻击停泊在安齐奥地区的盟军舰船。3月8日，6架S.79被部署到佩鲁贾的前进机场，3月10日执行作战任务。1艘7000吨的船被击中，但1架S.79被盟军夜间战斗机击落。3月14/15日晚，剩下的5架S.79攻击了内图诺地区的敌军，但无战果。在返回戈里齐亚途中，2架S.79被沿亚得里亚海岸活动的英国夜间战斗机击落。
　　早些时候，第一战斗机大队也进行了一次激烈的战斗，声称击落4架B-24和8架P-47，自己损失了4架马基C.205。“蒙台富斯科”补充战斗机中队的一个空中巡逻队于3月13日从都灵附近的米拉菲奥里紧急起飞执行了该部队的首次战斗任务。
3月18日，回应法西斯空军日益增长的力量，盟军空军对弗留里地区的机场进行了猛烈的轰炸，第1战斗机大队和“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队都驻扎于此。轰炸机群遭到德国Bf-109和ANR的30架马基C.205的截击，拦截者声称击落4架B-24和3架P-38，可能击落2架-24和1架P-38，自己损失2架C.205。在乌迪内，2架C.205在地面被击毁，12架被击伤。在戈里齐亚，1架S.79被击毁，3架被击伤。
　　剩余的S.79被分散布置在洛纳台·波佐洛和维内格诺。第1战斗机大队开始了1星期的激烈战斗，声称击落10架，自损2架，战斗的高潮是3月29日，几乎同时起飞了所有3个ANR战斗机部队的飞机。20架第1大队的C.205与30架P-38战作一团，取得1架证实的战绩和4架可能击落，自己损失2架。“蒙台富斯科”补充战斗机中队从维纳里亚·里阿雷紧急起飞6架G.55，声称击落2架B-24和可能击落1架，还有1架B-24迫降于维内格诺，自己损失2架G.55及中队长博内特〔Bonet〕上尉。最后，第2战斗机大队进行了首次战斗，4架G.55从布雷索起飞，没有取得战果。
1944年4月初，“泰拉齐亚诺”运输机大队在戈斯拉尔用了几个月检修S.81后，开始以德国的番号第10〔意大利〕运输大队〔作为德第14航空军一部〕在中，东欧执行任务。从其在 Schaulyay 的基地，该部队飞行于芬兰、东普鲁士、波罗的海国家和捷克斯洛伐克。与此同时，第2“特拉布齐”〔Trabucchi〕运输机大队成立于奥里奥·阿尔·塞里奥，有3个中队，指挥官为萨纳尔迪〔Zanardi〕少校。得到首批S.82后，该大队得以开始训练直到1944年春，而后该部将前往戈斯拉尔。

ANR的S.79bis，隶属“法吉奥尼”鱼雷轰炸机大队，洛纳台·波佐洛，1944年春

1944年4月，对于第1战斗机大队和“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队来说，都是一个繁忙的月份，而后者蒙受了更惨重的损失。4月6日，“布斯卡里亚”鱼雷机大队在从维内格诺到佩鲁贾的转场飞行中遭到8架P-47战斗机的伏击。12架S.79中有4架被击落，另一架迫降。尽管有如此损失，4月10日，还是有4架S.79攻击了内图诺湾的盟军船只，声称击沉3艘。损失了2架鱼雷机，其中1架属于大队长法吉奥尼上尉，另有1架受伤在回航洛纳台途中迫降。几天后，马里尼〔Marini〕上尉接替担任大队长。
第1战斗机大队共有9次出击，在弗留里、奥地利南部和克罗地亚上空与敌机进行了6次交战。声称击落盟军轰炸机和战斗机各4架，自己损失5架马基C.205战斗机。
　　当盟军受困于安其奥-卡西诺一线时，ANR的行动陷于战线之后，这是由于RSI的防御姿态。无论战术上还是战略上，ANR都力图对抗盟军第12和第15航空队的中型和重型轰炸机对德国与意大利北方工业区之间后勤和交通线的攻击。
在最初的怀疑之后，德国人开始当ANR当作一支有效的RSI的武装力量，并依靠她来对付盟军日益增长的空中优势。然而，使用德意战斗机混编部队的问题在4月29日明显暴露出来：JG.77的Bf-109攻击了一支第1战斗机大队的编队。他们错误地将马基C.205当成了对方的“野马”，2架C.205被击落，飞行员阵亡。
　　第二天，20架第2战斗机大队的G.55战斗机进行了第一次战斗，声称可能击落1架B-24轰炸机，但也损失了第一位飞行员。到5月中，第1战斗机大队紧急起飞18次，击落2架P-51、1架P-38及4架轰炸机，损失3架C.205。5月12日，在一次P-38战斗机对雷焦·艾米利亚机场的突然袭击中，2架C.205在地面被击毁。在2天后对该机场的又一次攻击中，又有6架战斗机在地面被重创。5月份只有一次战斗，25日，10架第1大队的C.205和16架第2大队的G.55声称击落1架轰炸机并可能击落了3架P-38，但各损失1架战斗机。
第1战斗机大队曾短暂地退出战斗，一方面因为飞机和人员的重大损失，另一方面也由于一些飞行员对政府的反叛，他们厌倦了主要被用于减轻德国空军战斗机的负担而非保卫自己的城市。同时，受制于备件和发动机供应问题〔菲亚特于4月24日再遭轰炸〕，第2战斗机大队开始装备Bf-109G-6战斗机，大部分是新飞机，也有一些是从JG.53第2中队和JG.77第1中队移交的使用过的。飞行员的训练开始于6月。第2大队原来的G.55转交给第1大队，以补充其损失。
　　与此同时，“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队正准备进行一次可观的再出击——目标是直布罗陀。为了执行此任务，10S.79于6月3日被部署到法国的伊斯特尔〔Istres〕基地。这次大胆的行动于6月4/5日晚实施，繁忙的港口的灯光使之更加容易得手。意大利人声称击沉4艘敌舰船，共3万吨，另有2艘被击中。由于袭击持续了一定的时间，英国的夜间战斗机进行了截击，没有鱼雷机被击落，但有2架迫降于西班牙领土。此次攻击没有被大肆宣传，因为第二天就发生了盟军在诺曼底的登陆——“霸王行动”。但对直布罗陀的袭击还是证明了“北方”空军的士气和勇气，仍然是一支有效的空中力量。
6月7日，第2“特拉布齐”运输机大队开赴德国，装备着48架从德国“租借”的萨伏亚·马尔凯蒂S.82运输机。在得到一些“博内特”中队〔即原“蒙台富斯科”补充战斗机中队，为纪念阵亡的中队长，以其命名，并在机首饰以其花体签名〕的飞机和人员补充后，第一战斗机大队重新出战。在6月4—20日间，共有9次紧急出动，3次接战，击落2架B-24，自己损失4架G.55和1架C.205。然而，战斗疲劳和持续的伤亡使第1大队的士气迅速下降，ANR将一些飞行员退出一线战斗。阿拉比托〔Arrabito〕上尉接替维斯孔蒂上尉任大队长，3个中队中的1个被解散，由“博内特”中队顶替。
在最终完成在Bf-109G-6上的训练后，第2战斗机大队于6月24日重新出战，声称击落2架法国“拉法叶特”大队的P-47战斗机，自身无损失。
7月和8月对战斗机和鱼雷机部队来说都是繁忙的日子。第1战斗机大队有7次交战，击落3架P-47和1架“喷火”，自己损失11架C.205和7名飞行员。7月1日和20日，该大队各损失4架飞机。中队长阿拉比托上尉于20日阵亡，维斯孔蒂上尉重任中队长。与此同时，以维罗纳附近的自由镇为新基地的第2大队使用Bf-109G-6战斗机取得了可观的战绩：在17次交战中，以12架Bf-109的代价，击落了10架A-20、6架P-47、4架“喷火”、3架B-24和1架P-38。
在7月6日于巴里港外击沉击伤各1艘敌船后，“布斯卡里亚”鱼雷轰炸机大队的8架S.79转往雅典，以在东地中海进行活动。7月9—12日，执行了3次战斗任务，2架S.79油尽迫降。该部因此临时回到意大利，但7月29日在洛纳台机场，6架S.79于地面被摧毁。尽管如此，7月31日，14架S.79重回希腊，到8月11日共击沉10艘敌船、击伤2艘，自己损失4架飞机，其中2架在转场途中被德国高射炮击落。

不死鸟行动”〔Operation Phonix〕及其影响
　　第3战斗机大队于8月上半月正式成立，由2个装备马基C.202战斗机的独立中队组成，这2个中队都是在1944年上半年自发成立的，装备各种可得到的飞机，但从来没有达到作战状态。第3大队还吸收了战斗机教练中队的人员。马尔维齐〔Malvezzi〕上尉任大队长，但由于飞机型号混杂，到8月中以前都没有达到作战状态。根据安排，第3大队将接收第1大队装备Bf-109G-6〔德国第77战斗机联队回国留下的〕而替换下来的马基C.205和菲亚特G.55战斗机。
但随后该计划与德国驻意大利空军司令部的决定产生了冲突。德国人从来不愿接受从“停战”以来的ANR在政治上和作战上的独立性，不仅因为ANR是RSI的最有效的武器力量之一，还因为其最少受政治的影响也离RSI政府的姿态最远。在RSI成立初德军将ANR的人员纳入德国空军的企图失败后，1944年8月德军又开始实施代号“不死鸟行动”的吞并计划。
德国驻意大利空军司令里希特霍芬将军于1944年8月25日向所有的ANR单位派去了德空军军官，在有的地方其武装卫兵甚至封锁了机场出口并控制了电话交换台。ANR的人员被告知ANR已经被解散，他们必须选择加入德国空军的“意大利军团”〔Italian Legion〕或德国高射炮师。
一些军官和支援单位的反应温和，但作战部队则反应激烈，几乎引起武装冲突。第1战斗机大队放火烧了自己的飞机，而不是投降。第2大队则干脆在机场哨所就把德国人赶走了。闻知此事，墨索里尼迅速向希特勒提出抗议。里希特霍芬及其参谋人员被召回柏林，由冯·珀尔〔von Pohl〕将军代替。
德军收回了第2大队的“梅塞斯密特”飞机，因此2个战斗机大队都没有飞机了。“布斯卡里亚”鱼雷机大队因为代价惨重的爱琴海行动而正在重组。“不死鸟行动”的后果是ANR几乎瘫痪了2个多月。　　认识到一支有效的意大利战斗机部队能够节省下德国空军战斗机用于保卫德国，冯·珀尔重又向ANR提供了合作和支持。决定将第1战斗机大队开往德国进行Bf-109G战斗机的转换训练，第3战斗机大队也将如此。与此同时，当最后1个德国战斗机联队于9月底回国后，第2战斗机大队成为意大利北部唯一的战斗机单位了，该部也将重新装备BF-109G。

9月，ANR重组。补充战斗机大队〔Gruppo Complementare Caccia〕、鱼雷机司令部、“埃托雷·穆蒂”〔Ettore Muti〕轰炸机中队〔从来没有达到作战状态〕及一些较小的单位被解散。第1战斗机大队解散现有的中队，改为3个中队和1个以地面分队〔Sezione di Gruppo〕，并以“棍棒王牌”〔Asso di Bastoni〕为名。当得知布斯卡里亚少校〔原以为在布日湾阵亡〕被俘并加入南方空军后，“布斯卡里亚”鱼雷机大队改名为“法吉奥尼”，以纪念这位在战斗中阵亡的前任大队长。
10月19日，ANR重新出动。第2战斗机大队的“梅塞斯密特”迎战第319轰炸机大队的B-26，声称击落8架〔实际有3架被击落〕，损失1架Bf-109G。10月还有2次战斗，击落盟军飞机3架，自己损失3架Bf-109。
在东线支持德军的意大利“泰拉齐亚诺”和“特拉布齐”运输机大队，受到苏军推进的压力不断向西退却。由于不断撤退和处境困难，10月28日，人员奉命撤回意大利，但飞机被留下。由于在意大利没有类似的飞机，该两大队人员被组成反游击队营。“泰拉齐亚诺”共执行任务6个月，2500飞行小时。2个大队共运输军队3000人次，装备2300吨。
1944年11月，美国地中海陆军航空队〔MAAF〕被迫采取措施对付第2战斗机大队，该大队在11月4—16日从其在阿维亚诺的新基地起飞进行了5次战斗，声称击落7架B-17、5架B-26、2架P-47、2架P-51，损失4架Bf-109G。11月17—22日，MAAF对在杰迪、自由镇和阿维亚诺的机场进行了一系列的猛烈袭击。7架Bf-109G在地面被击毁。但飞机的损失远不如飞行员的损失，因为现在德国人愿意提供补充的飞机。
从11月初起，第1战斗机大队开始在德国 Holzkirchen 的转换Bf-109G训练，第3大队于12月中起在 Furth 开始同样的训练。部分第1大队的飞行员还得到机会进行革命性的梅塞斯密特Me-163“彗星”火箭动力截击机的训练，但糟糕的天气和苏军的迅速推进使意大利人没能够完成训练。

最后一个冬季
在意大利战线，严寒的1944/45年冬天严重减少了作战行动，12月，第2战斗机大队只有3次战斗，但声称击落5架B-25、3架P-51和1架“喷火”，自身只损失1架Bf-109。但在第350战斗机大队的P-47战斗机对蒂埃内机场的攻击中，有14架Bf-109G-10在地面被摧毁。
12月26日，“法吉奥尼”鱼雷机大队以4架S.79重新出击，在安科纳外击中1艘7000吨的船只。1945年1月5日，该大队进行了最后一次任务，2架S.79声称在亚得里亚海击沉了1艘5000吨的敌船。为了缓和大大影响大型3发鱼雷机活动的燃油短缺，有人建议“法吉奥尼”大队改装单发单座的菲亚特G.55S鱼雷轰炸机，1945年3月试飞成功的原型机。但该建议没有被采纳，“法吉奥尼”鱼雷机大队停止了活动，共计击沉13艘商船和1艘驱逐舰，共11.5万吨。损失12组乘员〔60人〕。
到1945年初，意大利北方的ANR的战斗机部队只有第2战斗机大队了。即使这些有限的飞机，燃油和备件的短缺也严重影响了飞行。面对盟军巨大的空中优势，ANR的战斗机部队几乎聊胜于无。
到1945年2月，3个大队各中队的编号变成如下：
第1战斗机大队：第1、第2、第3中队；第2战斗机大队：第4、第5、第6中队；第3战斗机大队〔没有达到作战状态〕：第7、第8、第9中队。
1月，飞行活动为天气所阻，但2月作战行动密集展开，部分是因为1月底第1战斗机大队从德国归来，装备了52架装有最新的DB605AS和DB605D发动机的Bf-109G-10战斗机。当第3大队还在 Furth 继续训练时，维斯孔蒂少校的第1大队已经在马尔潘萨〔Malpensa〕和洛纳台·波佐洛机场完成了作战重组。
在米亚尼〔Miani〕少校〔1944年底接替阿莱桑德里尼中校任大队长〕的指挥下，第2大队2月进行了4次战斗，拦截攻击布伦纳隘口交通线的MAAF的轰炸机。声称击落了10架B-25和1架“喷火”，损失6架“梅塞施密特”战斗机。
为了加强战术侦察力量以获取有利于德国地面部队反击想象中的盟军对 Gothic 防线的进攻，德国空军司令部〔OKL〕决定在意大利部属一支装备喷气式飞机的侦察部队。3月中，3架阿拉多Ar-234被部署到坎波福尔米多，直到战争结束。第2战斗机大队2个中队奉命在其起飞和降落时提供保护。将Ar-234置于意大利中队的保护反映出德空军对ANR的一定的信任和尊敬。
滑翔机学校〔Scuola di Volo a Vela〕是最后建立的ANR单位，于1945年3月初正式成立。但却实际运行了几个月，完成了新飞行员的训练。
结局
1945年5月3日，第2战斗机大队的22架Bf-109G攻击了一个属于第3 SAAF大队的B-26“掠夺者”轰炸机编队，声称击落8架、自己损失2架“古斯塔夫”〔实际上，盟军没有损失B-26，但损失1架护航的“喷火”〕。但这是该大队的最后声称的战果，压倒性的盟军空中优势迫使该部的活动只能减少到零星偶尔的出动。
第1战斗机大队3月14日终于重回战场，对付第350战斗机大队的“雷电”，但战果令人失望。美军成功拦截了意大利战斗机，意军在战斗中损失了3架Bf-109G，还有3架毁于迫降，但只声称击落1架敌机，这也是维斯孔蒂少校在ANR的第7个也是最后1个战果，他总共的未经证实的战绩是26架〔包括在皇家空军时期的19架〕。但真实战绩应该至多是25架，因为维斯孔蒂声称击落的那架埃迪〔Eddy〕中校的P-47，并没有被击落，在两人的迎头交锋中，是维斯孔蒂受伤被迫从其Bf-109跳伞。
同时，第2战斗机大队在3月中得到13架德国新的“古斯塔夫”补充。德空军司令部考虑给1个意大利中队装备“梅塞施密特”Me-262喷气战斗机。杰迪和自由镇的机场做了改造以适应喷气机。意大利战线的崩溃使该计划没有实施，但这反映了德军对ANR的尊重。3月23日，第2战斗机大队遭遇了美国陆航的B-25，声称击落3架“米切尔”和1架护航的P-47。
4月2日，22架“梅塞施密特”紧急起飞拦截飞往布伦纳隘口的一个B-25编队，但遭2个独立的P-47护航编队的袭击。损失了14架Bf-109和7名飞行员，盟军方面没有损失。这对第2大队是个打击，但在盟军占压倒优势的战场是无法避免的。盟军战斗机自由地出没于空中，攻击每个可能的目标。