基于微流控技术的单细胞分析，单细胞测序技术与应用，Linux 及 R 语言入门与实操，单细胞转录组数 据分析思路流程及实操，多组学整合分析和结果解读，单细胞转录组轨迹、通路、转录因子等分析及绘图实操 等。
第一天 全天 基于微流控技术 的单细胞分析 1. 微流控技术与单细胞分析概述 2. 基于微流控技术的单细胞样品制备（稀有细胞微流控分选、 单细胞捕获与分析、微芯片式细胞培养） 3. 单细胞的微流控检测（基于亲和反应、基于细胞物理特性） 与分析技术 4. 微流控细胞分析技术在生物医学（肿瘤早期检测、其他领域） 中的应用 理论 第二天 上午 单细胞测序技术 与应用 1. 单细胞组学技术发展历程和原理介绍。 2. 单细胞测序技术在科研领域的应用。 3. 近年单细胞方向高分文章思路解析。 4. 单细胞组学和多组学整合分析思路和案例介绍。 理论 第二天 下午 Linux 及 R 语言 入门与实操 1. 常规基础 Linux 命令入门讲解及实操训练。 2. R 语言简介及安装，RStudio 的安装及使用说明。 3. R 语言语法介绍及常用命令。 4. 数据处理功能及统计应用。 5. R 语言画图实操。 实操 第三天 上午 单细胞转录组数 据分析思路及流 程 1. 单细胞实验处理、建库及测序。 2. 单细胞转录组比对、定量、分群及拟时间分析等分析思路。 3. 单细胞转录组转录因子及功能通路解析。 4. 单细胞组学技术在癌症、发育、免疫及在植物、微生物等领 域的研究内容及思路。 理论 第三天 下午 单细胞转录组数 据分析实操 1. 常规单细胞组学数据比对。 2. 10X 官方单细胞软件Cellranger 讲解及实操。 3. 从基因表达矩阵开始到marker 基因筛选全过程讲解及实操。 4. 通过 Seurat 软件进行PCA 及 tSNE 降维。 5. 单细胞转录组细胞鉴定及聚类分析。 6. 通过 Seurat 及 GSVA 等进行单细胞转录组差异分析。 实操 第四天 上午 多组学整合分析 和结果解读 1. 转录组，基因组，表观分析介绍。 2. RNA 和 ATAC-seq 等多组学整合分析。 3. 常规 10X 单细胞 ATAC 数据测序原理简介、分析流程介绍。 4. 单细胞免疫组库测序技术及应用。 5. 组学分析常用数据库介绍及使用。 理论 第四天 下午 单细胞转录组轨 迹、通路、转录 因子等分析及绘 图实操 1. 通过 Monocle 软件进行单细胞转录组拟时间分析。 2. 通过 DAVID 及 metascape 网站进行通路富集分析。 3. 通过 SCENIC 软件进行转录因子预测分析。 4. tSNE，小提琴图，热图，网络图，GO、KEGG 富集图，GSEA 等图形绘制。 实操