吞咽障碍的患者服药时往往存在一定困难，即使通过鼻饲管和胃造瘘管送药也有一定内在的问题。通常所采用的方法是将药物碾碎，用水溶化，然后经过鼻饲管或者胃造瘘管送入胃内。也可以采取改变药物成分和给药途径的方法，但并不是所有药物都适合于碾碎后服用，这样可能会改变药物的药代动力学或者效能。将几种药物在一个碾钵中碾碎混合并一起服用，也可能造成药物之间的相互作用。因此，管理吞咽障碍的患者时，应该咨询医院内药师或药物信息中心，寻求最适当、最安全的给药方法。
能部分经口进食的患者服用药片或胶囊时，可选择凝胶(如常用的和药顺)包裹后送服。以确保药物的治疗作用与进食安全。