臭氧发生器杀菌与紫外线灯管管照射杀菌相比同样具有特殊的优越性:
1、臭氧到处渗透，没有死角。紫外线灯管只有照射到物体表面且达到一定的照射强度标准才有杀菌效果。食品车间一般比较高大，致使紫外线灯管管照射强度远远不够，特别是距离远，照射产生很大死角，如加工案板下部等。臭氧为气体，渗透性强，扩散性好，浓度均匀，没有死角;
2、杀菌速度快。紫外线灯管管照射杀菌需要较长的作用时间，一般要照射6小时以上，而符合标准浓度的臭氧只需开机1小时以上;
3、高湿度下杀菌效果更好。 紫外线灯管管照射杀菌在环境相对湿度达到60%以上时，消毒效果急剧下降，湿度达到80%以上时反可诱使细菌复活。臭氧则相反，湿度越高，杀菌效果越好。
这是由于高湿度下细胞膜膨胀变薄，其组织容易被臭氧破坏，这一特性对于食品行业中普遍存在的高湿环境特别适合;
4、有低浓度保洁功能。紫外线灯管照射时生产人员必须离开现场，照射完成后无法用低功率的紫外线灯管照射保洁;臭氧消毒时生产人员必须离开现场，消毒完成后可以调低臭氧发生量，用符合国家卫生标准的低浓度臭氧继续保持生产车间的空气清洁。