方舟上古神器的作用是用来兑换各种奖励与召唤特殊BOOS的材料，玩家拿到神器后，去地图上的3座方舟，找到中间一根柱子，对柱子（也就是准贡品终端）打开背包，然后在背包中选中神器，背包下方会显示一个贡品字样，点击后，即可上交到方舟终端中领取到奖励。
需要注意的是不同的神器上传获得的奖励均不同。