可能有皇后，只不过因为政治斗争被抹去了。
秦始皇对外戚势力非常警惕，他本人深受外戚之苦，好不容易干翻了出自楚国的华阳夫人，出自韩国的夏夫人韩夫人，出自赵国的赵夫人这几波外戚势力，而嬴政的皇后(如果有的话)，大概率出自楚国，因为当时华阳夫人还在，嬴政娶楚国女为后的可能性最大，灭掉楚国外戚势力的时候一起带走了然后从史书抹掉很有可能。
参考汉文帝有一个老婆被抹掉姓名，很多人认为可能是吕氏女。
也可能压根没有皇后，因为秦始皇深受外戚势力之苦，干脆不设皇后以压制外戚。
换句话说，秦始皇压根不可能正儿八经立个皇后出来。