合并财务报表中少数股东权益的计算，需要先计算出被合并公司的净利润，再计算出少数股东在该净利润中所占的比例，最后将该比例乘以少数股东的权益，即可得到少数股东权益的数值。具体计算方法为：被合并公司净利润×（1-母公司持股比例）=少数股东权益。比如，被合并公司净利润为1000万元，母公司持股比例为80%，则少数股东权益为1000×（1-0.8）=200万元。