如果经营许可证不是最新版本，需要及时更新。具体流程可以通过向当地工商局或市场监管部门咨询获得。一般情况下，更新经营许可证需要提供相关材料，如企业营业执照、法人身份证等。更新后的经营许可证是企业合法经营的重要凭证，能够为企业赢得更多市场信任和商业机会。

如果您的经营许可证不是最新版本，您可以按照以下步骤进行处理：
查明原因：首先，了解为什么您持有的经营许可证不是最新版本。可能是因为证件过期、规定发生变化或您没有及时进行更新。
联系相关部门：与负责颁发经营许可证的当地卫生部门、食品药品监管部门或其他相关机构取得联系。询问他们关于更新许可证的程序和要求。
提交申请：根据相关部门的要求，填写并提交许可证更新申请。通常，您需要提供一些文件和信息，如企业资料、新版申请表格、费用支付等。
符合要求：确保您的小作坊符合最新的法规和标准。这可能包括进行一些设施改善、采取卫生措施、更新操作流程等。
审核和审批：提交申请后，相关部门将对您的申请进行审核，并可能进行现场检查。确保您与审核人员进行合作，并按照要求提供所需的信息和文件。
更新证件：一旦您的申请获得批准，您将获得新版的经营许可证。请确保及时更新您的证照，并将其在经营场所展示出来，以便监管机构进行检查。