日本海运发达的主要原因是其地理优势，地处亚洲与北美洲之间，毗邻太平洋，拥有众多海湾和海港，有利于海上贸易和海运业发展。此外，日本海岸线曲折有利于优良港湾的形成，加上政策扶持和工业区分布在沿海地区，也促进了海运的发展。