是的，农村初中毕业也会有档案。农村初中毕业档案包括但不限于学习考试成绩单，学习奖励表，各种经历证明，考生基本信息，家庭信息等。这种档案可以证明学生学习、生活的情况，以便未来就业时作为参考。