学校下设珠海校区、基础医学院、第一临床学院、口腔学院、人文社科部、公共事业管理系、麻醉学系、药学院、护理学系、美容医学系、医学影像学系、医学检验系 、法医学系、社会体育系、外国语言文学系、生物工程系等16个级办学单位，教研室116个，教学与科研实验室22个，直属附属医院3所，非直属附属医院6所，教学医院25所，非医学类实践教学基地25个，研究所4个。设有涵盖医学、教育学、管理学、文学、理学、工学6个学科门类的13个专业：临床医学、口腔医学、麻醉学、公共事业管理、药物制剂、护理学、医学影像学、医学检验、社会体育、生物工程、信息与计算科学、英语、法医学，其中口腔医学、麻醉学为国家级特色专业，临床医学、口腔医学、麻醉学、医学影像学、药物制剂、护理学为省级示范性本科专业。有国家级精品课程1门，省级精品课程12门，校级精品课程22门，校级优质课程10门。临床技能实验教学中心为国家级实验教学示范中心；药理学、分子生物学、内科学、口腔临床医学、麻醉学为省级重点学科；小儿外科、肿瘤科、麻醉科为省级重点医疗专科；17个硕士学位授权点；1个联合培养博士基地。
