在选择当地差额乡镇卫生院事业编和差额二甲医院事业编时，以下因素可以作为参考：1. 薪酬待遇：一般来说，二甲医院的薪酬待遇可能会更高，因为其医疗水平和专业要求相对较高。但是，乡镇卫生院也有其特殊的吸引力，如较低的生活成本、安宁的生活环境等。2. 专业发展：二甲医院通常拥有更先进的医疗设备和技术，对应聘者专业发展的要求也较高。如果希望在医疗领域有更深入的发展，二甲医院可能更合适。3. 工作压力：二甲医院的工作压力通常较大，因为其服务的人群数量和种类相对较多。而乡镇卫生院的工作压力相对较小。4. 稳定性：两者在稳定性上没有明显的优劣之分。无论是乡镇卫生院还是二甲医院，都需要通过事业单位考试才能获得事业编制，因此稳定性都相对较高。最终选择的决定权还是在自己手中，可以根据自己的实际情况和兴趣来进行选择。如果更看重专业发展、较高的薪酬待遇和较大的城市生活体验，那么二甲医院可能更适合。如果更喜欢宁静的生活环境、想要有更多的时间陪伴家人或者更看重稳定性，那么乡镇卫生院可能更适合。