剧中地位层级很分明，能根据角色互动态度，判断两者地位高低。
胡宗宪和杨金水互相客气。杨金水的职责是监察，胡宗宪的职责是总管。理论上，杨金水的地位应该比胡宗宪高，略高或者高半级。但是两人相处是互相客气，反映出二人实际地位平级。
郑泌昌、何茂才比胡宗宪低，比马宁远高。何茂才敢呲哒马宁远“认死理”，对胡部堂背后敢议论，表面始终毕恭毕敬。
沈一石在郑和面前永远逆来顺受，就算是在马宁远（知府）面前，也是只有听的份儿，面对高翰文（知府）也始终恭敬，但是敢暗中下套；但是在第一次见海瑞（知县）时，故意留在船上摆架子，语气也略有上位者之意，也敢当面用穿绸、官服给海瑞下马威。
沈一石跟知县的地位差别，看起来跟胡宗宪与杨金水一样，是平级。