方便快捷
琼脂糖预染预制胶是预先制备好的，不需要像传统琼脂糖凝胶那样在实验时现场配制、加热、倒胶等一系列繁琐的步骤。使用者可以直接从包装中取出凝胶就能够进行后续的电泳实验，节省了大量的实验准备时间，尤其适用于需要快速得到实验结果或者进行高通量实验的情况。
含有染料

预染的特点使得在电泳过程中，核酸分子（DNA 或 RNA）的迁移情况可以被直接观察。例如，常用的荧光染料如溴化乙锭（EB）替代品（如 GelRed 等）能够嵌入核酸双链的碱基对之间，在紫外线的激发下发出荧光，从而让使用者实时看到核酸条带的位置和分离情况。这种可视化的特点有助于及时调整实验参数，比如电泳电压和时间等。
凝胶质量稳定
预制胶是在标准化的生产条件下制作的，其琼脂糖的浓度、孔径大小等参数都经过精确控制。这确保了每次实验使用的凝胶质量一致，减少了因为凝胶质量差异而导致的实验误差，使得实验结果更具重复性和可比性。
安全环保
一些琼脂糖预染预制胶采用了更安全的染料配方。传统的溴化乙锭（EB）是一种强诱变剂，具有一定的毒性，而新型的预染预制胶中使用的染料如 GelRed 等毒性较低，降低了实验人员接触有毒有害物质的风险，同时也减少了对环境的污染。

作用
核酸分离与鉴定
琼脂糖预染预制胶能够根据核酸分子大小的不同对其进行分离。在电场的作用下，核酸分子会在凝胶的孔隙中向正极迁移，较小的分子能够更容易地通过凝胶孔隙，迁移速度更快，而较大的分子则迁移得较慢。通过这种方式，可以将不同大小的核酸片段分离开来。例如，在 DNA 的限制性内切酶酶切产物分析中，能够将酶切产生的不同长度的 DNA 片段分离，形成特定的条带图谱，从而帮助研究者确定酶切是否完全、DNA 片段的大小是否符合预期等。
核酸定量分析的初步手段
根据核酸条带的亮度，可以对核酸的含量进行初步的定量分析。一般来说，在一定范围内，核酸条带的亮度与核酸的含量成正比。例如，在比较同一基因在不同样本中的表达量时，如果是通过逆转录 PCR（RT - PCR）得到的 cDNA 产物，其在凝胶上的条带亮度可以大致反映该基因在不同样本中的相对表达水平，为后续更精确的定量分析提供参考。

监测实验进程
在核酸的提取、扩增等实验过程中，可以使用琼脂糖预染预制胶来监测实验的进度和效果。例如，在 PCR 反应后，通过电泳可以检查是否成功扩增出目标 DNA 片段，以及是否存在非特异性扩增产物。如果看到了预期大小的明亮条带，且没有其他杂带，那么就可以初步判断 PCR 反应是成功的。