最早的青蒿应该记录于《神农本草经》，不过记载并不明确，后来人渐渐开始分辨不同种的青蒿，到宋代为止描述基本完善。而明代《本草纲目》上的青蒿基本可以明确就是黄花蒿了

那为啥古代还是疟疾肆虐

黄花蒿
（《纲目》）
【释名】臭蒿 【集解】大明曰∶臭蒿一名草蒿。
时珍曰∶香蒿臭蒿通可名草蒿。此蒿与青蒿相似，但此蒿色绿带淡黄，气辛臭不可人家采以罨酱黄酒曲者是也。

翻译问题，小日本翻译错了

黄花蒿和青蒿是两个品类，颜色味道都不一样

《头注》在中药‘青蒿’项下，却错误地注以学名Artemisia apiacea Hance， 而在‘黄花蒿’项下，反而注以植物学名Artemisia annua L.。自此就把从古代沿用下来的具抗疟疗效的中药青蒿定为A.apiacea，又把李时珍通过本人医疗实践发明为主‘小儿风寒惊热’的中药黄花蒿，定为A.annua，可见最早的错误出自《头注》。以后又因植物学名而分别称之为植物青蒿（A.apiacea）及植物黄花蒿（A.annua），并列为重要青蒿。

传统医学中或许存在一些有用的东西，但这和传统医学本身其实没多大关系。传统医学存在那么多年，用穷举法碰巧发现一些有用的东西也是必然，但是传统医学自身的逻辑就决定了，他们认为有用的东西中，哪些是真的和患者的痊愈存在相关性，哪些只是碰巧在患者痊愈之前用过造成了这个东西和痊愈存在相关性的错觉，传统医学的理论和逻辑都无法真正意义上做出正确的判断。所以说，即使是传统医学当中存在那点凤毛麟角的有用的东西，也和传统医学自身没多大关系，有苦劳，但没有功劳。