经云：一切众生，从无始来，种种颠倒，业种自然，如恶叉聚；诸修行人，不能得成无上菩提，乃至别成声闻缘觉，及成外道、诸天、魔王及魔眷属，皆由不知二种根本，错乱修习。云何二种？
一者，无始生死根本，则汝今者与诸众生，用攀缘心为自性者；
二者，无始菩提涅盘元清净体，则汝今者识精元明，能生诸缘缘所遗者。
第一个是生死根本，第二个是涅盘根本。在持名中，文殊菩萨云「念性元生灭」，这就是生死根本。大士此处，卖了个关子，没有把涅盘根本说出来。念性，等于反闻中倒反之闻机，就是「何不自闻闻」中第一个闻，属于识，后面的第二个闻是闻性，才是根，亦即涅盘根本。相应地，在持名，念后面的那个佛，才是如来密因、圆通本根。为什么要卖个关子？因为如果说亮话，众生往往只过一下耳，没有在意。所以特别的那个法门要密说，但是留下线索，等自己找出来之后，像挖到宝藏一样，希有、欢喜。
从生死根本到涅盘根本，就是所谓「一门超出妙庄严路」，它是一条道路，所以不要看到法门里还带着生死根本，就很害怕。这条路上刚刚出发，当然没有离开生死，但是它能帮你过度到涅盘，这就是「从根解结」。反闻这条路上要解六结、越三空，然后忽然超越世出世间，即达彼岸。持名呢？也要从根解结，但是此法，是他力解结，前面反闻是自力解结。所以经上说「不假方便」，就是不用自力去解，如果用自力，那还是耳根容易，持名解结不约自力。结解开之后什么境界？「情与无情，同圆种智」，换言之，情与无情全都是佛。这个时候六根互用，六根是一样的，叫「圆融清净宝觉」。现在我们是六面镜子，色法映现在见性镜里，声法映现在闻性镜里，实际上大圆镜是一面，没有六面，色声香味触法，都在一面镜子里映现。这个宝觉最大的作用，就是除一切苦，所谓「照见五蕴皆空，度一切苦厄」。观世音菩萨解结成功，获二殊胜，一个是慈，一个是悲。慈是惠一切乐，悲是除一切苦，一切就是圆通的意思。果地圆通起用，能帮助因地人得一切利益，所以才「求大涅盘得大涅盘」，持名有这种功德，这就叫「以果为因」。
经中密义很多，文殊菩萨说偈拣择，「云何获圆通」这一句也有深意，跟后文照应：「性比丘尼，闻说偈已，成阿罗汉。」这个阿罗汉，就是圆通境，圆教十地。阿罗汉翻作无学，经上说「菩萨已得首楞严三昧，则于诸法无所复学」、「唯有住在十地菩萨，乃能得是首楞严三昧」。性比丘尼就是摩登伽女，她的名字叫本性，名是表法的，她真是称性起修，所以成就不可思议。她是钝根，所谓「彼尚**，无心修行」，二障深重，这是根性最钝的一类众生。能叫最钝的人，一天之内成就法云地菩萨（设楞严经到文殊说偈拣择，是一天内），这个法门威势最大。譬如斧头极钝，不能劈柴，但是力量大的人还是能把柴破开，比喻法门力大，能让最钝的人冲破生死烦恼，这叫作「大势至」，威势达到极至的意思。此处有两点很隐晦：第一，摩登伽女得圆通；第二，她依根大得之。为什么？持名、咒力都是依出缠藏心为本根，而圆通章里是用持名，最是正宗，速、捷、顿，无过于此。何以见得？其余一切法中，耳根反闻最胜，经上说，依此法，如法去修，利根者一百天得须陀洹。这里是钝根人一天得阿罗汉。所以经文有况显的意思在，就是衬托，密中显出最特别的法门。这里的须陀洹，是圆教入住，明心见性，不是小乘初果，阿罗汉则是圆十地，非小四果，古德所谓「涅盘借小乘四果名位，以次当大乘住、行、向、地」。所以文殊菩萨刚说完「云何获圆通」，摩登伽女就证果了，一唱一和，都是线索。
大士本地，跟摩登伽女一样，经历非常相似。经上说，文殊因地得念佛三昧已，诸佛现前说无相法，须臾之间，得首楞严三昧。摩登伽女呢？佛说「彼尚**，无心修行，神力冥资，速证无学」。须臾、速证，都是说明顿超，是顿中之顿，径中之径，一门超出妙庄严路。