这个是儿缀，不是儿化音。儿缀自古有之，儿化音是特指近代的语音现象

宋代北方也处在中古音系时代

宋朝的儿不是卷舌er

儿词缀比较发达而已，恰巧儿这个字在当代杭州话里发音和普通话差不多，这和儿化音的区别还是很大的，儿化音是黏着在前字后不成音节的，与前字合一块形成一个新音节，儿词缀就是单独在词语后加一个单独发音的儿字。
儿词缀在中古汉语里就是比较流行的，后来逐步被子词缀代替了，比如‘老头’这个词，北方官话儿化音表达是lao tour，杭州话加儿词缀的是lao tou er，普通话里常用的子词缀表达是 lao tou zi。
杭州话儿词缀比例高当然和宋室南迁有关，仅就这一点上说，简直是中古汉语的活化石了。
至于杭州话为啥‘儿’这个字的发音和普通话这么像，那也是因为自元代开始汉语官话发音发生了较大的变化，儿这个字的发音主流就成了er。如果你是明清时期的一个宁波人，将来考取功名去外地赴任，讲宁波话肯定是无法与同僚们沟通的，所以浙江学子要掌握一门能让官话人群也能基本听懂的吴语文读音。杭州话明清两代一直都是省城，而浙江读书人又多，明清时期乡试都是在省城考的，于是省内的读书人必然云集在杭州，再加上杭州经济发达，南来北往的商贾也多，久而久之这种通用性更强的吴语文读音就成了杭州话，而‘儿’字的发音也就成了er了。