1.A结局，对应A路线，操作2B。
2.B结局，对应B路线，A路线结束后就会自动开始，剧情和A路线一样，只是操作9S。
3.C结局，B路线剧情的后续，最终之战选择9S。
4.D结局，B路线剧情的后续，最终之战选择A2。
5.E结局，看过C和D后再次选择其中之一会触发。
最后值得注意的是E结局：选择YES，存档会有E 画面改变为9S武器和背包。(但是存档被删了，这个E也就没了)。选择NO，存档会有E 画面维持为月之花。因此许多人会选择YES，但是YES会造成存档被删，怎么办呢?方法还是有的，游戏存档其实分为2部分：SYSTEM系统存档和角色存档。游戏开始画面是什么样，存放于SYSTEM系统存档;而结局完成数，角色数据，道具，收集度等在角色存档里。选择YES，仅仅是删除了角色存档。

尼尔机械纪元游戏的主线剧情其实并不是特别的长，但是结局有很多，以下是具体情况。
结局：
1、A结局：flowers for m[A]chine

也可以称之为一周目，在控制2B走完主线就能够达到A结局。
2、B结局：or not to Be
正常完成主线二周目就可以触发B结局。

3、 C结局：meaningless [C]ode
三周目最终战，在A2和9S对决选择A2，后便可以顺应剧情发展得到C结局。

4、D结局：chil[D]hood*s end
最后一战，在A2和9S对决的时候选择9S，以此触发D结局。

5、 E结局：the [E]nd of YoRHa
这是真正的结局，在获得了C结局和D结局后，再进行一次最后战斗，任意选一个人即可。期间会有一个选择，应当选择接受Pod的要求，接着完成一个弹幕小游戏，结束后触发E结局。

6、 F结局：mission [F]ailed
选择章节：Ch.01-03_2，当9S被Boss攻击飞时，掉落到Boss背上，治疗的时候，不按规定，不在要求时间之中重新启动，挂机，等没有时间就能够触发F结局。

7、 G结局：hun[G]ry for knowledge
选取章节：Ch.01-01_2，机器人视角后开始操作9s，21O会向你传达瘫痪工厂防御设施的指令，不按指令来，直接从起重臂上跳下去。

8、H结局：a mountain to [H]igh
选取章节：Ch.05-02，选2B或者9S都可以。读档后在帕斯卡的村子，转身往后走，往图中左边岔路走，去游乐园就可以了。

9、I结局：no I in team
选取章节：Ch.08-01_2，2B在复制街道击杀亚当后，不去找9s，反方向离开即可。

10、 J结局：bad [J]udgement
选取章节：Ch.09-01_3，2B和帕斯卡到达工厂后击杀图中的祭祀。

以上是所有结局，祝各位玩家玩得开心。