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如何鉴定泛素修饰类型与靶蛋白修饰位点?

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如何鉴定泛素修饰类型与靶蛋白修饰位点?
一、泛素修饰类型鉴定。
使用HA-Ub-WT/KO泛素修饰系统检测修饰类型:使用HA-Ub-WT和HA-Ub-KO(K6,K11,K27,K29,K33,K48和K63)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。或再次使用HA-Ub-WT(K6R,K11R,K27R,K29R,K33R,K48R和K63R)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,再次明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。
二、泛素化位点鉴定使用靶蛋白修饰位点突变
鉴定修饰位点:结合生物信息学在线工具(UbPred和GPS-Uber),预测可能的泛素化位点,构建靶蛋白的位点突变体,与HA-Ub-WT质粒和E3连接酶共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,明确修饰底物的关键修饰位点。
三、靶蛋白修饰突变体构建验证:
构建靶蛋白的泛素化位点突变体,通过比较野生型与突变体的功能差异,验证泛素化位点的功能。
如有泛素修饰机制研究相关科研问题,欢迎留言来询探讨。


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