舰长打败崩坏后，为了不打扰伙伴们的生活，自己离开了。

在《崩坏学园2》剧情里，舰长最后下落并没有明确统一的设定。在不同的剧情线、活动或玩家创作内容中可能有不同走向，比如在一些剧情中可能是继续在崩坏世界中寻找解决危机的办法，也有说法是进入其他特殊空间或维度了。