2000年夏窗,弗洛伦蒂诺出人意料地当选皇马主席,他随即兑现了自己要全力收购菲戈的承诺。那绝对是一次地震级的交易,正处于职业生涯巅峰的巴萨队长转投死敌营垒,昔日代表红蓝精神的旗手放弃了信仰,菲戈冒天下之大不韪制造了一个经久不息的话题。同样是从巴萨转会到皇马,舒斯特尔和米歇尔-劳德鲁普的故事已经很少被人所提及,很多巴萨球迷还是将他们视作俱乐部历史的一部分,但菲戈却从未获得过巴萨球迷的原谅,这位曾被视为能够代表加泰罗尼亚理想的球员为昔日的盛名付出了沉重代价。
背负着巨大的争议,菲戈展现出了令人钦佩的大将风范,他没有在压力面前屈服,而是用球场上杰出的表现驱散了舆论的硝烟。2000/01赛季,皇马遭遇了严重的伤病危机,莫伦特斯和萨维奥都缺席了1/3以上的比赛,古蒂在很多比赛中被迫顶到锋线与劳尔搭档,菲戈几乎是凭借一己之力撑起了银河战舰的运输线,他的活动范围以右路为起点覆盖了整个中前场。尽管未能带领皇马重返欧冠决赛舞台,但菲戈的到来让皇马时隔四年后再次夺得西甲冠军,这成为了他争夺金球奖时最重要的筹码。
转会皇马后,菲戈在场上获得了很高的战术自由度,用球区域覆盖前场,他的表现征服了球迷。皇马在2000/01赛季夺得西甲冠军,菲戈的带队能力再次得到了证明。
2001/02赛季,随着齐达内的到来,菲戈的活动范围被固定在了右翼,但这并没有影响他的进攻效率。2001年12月17日,在国际足联世界足球先生的颁奖典礼上,菲戈在于劳尔-冈萨雷斯和大卫-贝克汉姆的角逐中胜出,荣膺当年的世界足球先生。在接下来的赛季中,菲戈还和队友们一起在格拉斯哥捧起了大耳朵杯,“银河一期”达到了巅峰。
银河战舰需要金球先生,作为弗洛伦蒂诺引进的第一位巨星,菲戈在皇马队史中的地位不容低估。
2002/03赛季,菲戈在联赛中打入10球,创造了职业生涯的新纪录,在欧冠与曼联的巅峰对决中,葡萄牙人在首回合里打进的精彩吊射成为了影响系列赛走势的关键。可惜的是,在半决赛对阵尤文的次回合较量中,菲戈罚丢了点球,这次卫冕欧冠的失利标志着“银河一期”开始转入了下行区间。
贝克汉姆并没有威胁到菲戈的地位,后者的能力可见一斑。
2003年夏窗,菲戈迎来了职业生涯中最严峻的挑战之一,弗洛伦蒂诺斥资3500万欧元引进了贝克汉姆,关于两人谁会出任主力右前卫的争论贯穿了皇马季前备战的始终。自从升入葡萄牙体育一线队之后,菲戈经历了克鲁伊夫、博比-罗布森、范加尔、博斯克和奎罗斯等多位名帅,期间既有过一览众山小的高峰体验,也曾数次因四大皆空而黯然神伤。不过,无论球队身处高峰还是低谷,菲戈的表现都是一如既往的稳定。事实证明,“银河战舰”曝光率的持续攀升并没有动摇菲戈的主力位置,贝克汉姆在后腰位置上开拓出了新天地,葡萄牙人依然是皇马的首发右前卫。
2005年夏天,弗罗伦蒂诺的巨星政策近乎疯狂,罗比尼奥、拉莫斯、巴普蒂斯塔、巴勃罗-加西亚和迪奥戈相继加盟。为了给年轻球员腾位置,节省工资开支,皇家马德里将菲戈免费送到了国际米兰。在征战西甲的十个赛季中,菲戈一共奉献了105记助攻,成为西甲历史助攻王,这个记录直到十年后才被巴萨的后辈梅西超越。