那时候的小智只是个热血少年，刚刚拿到八个徽章就有一名训练家前来挑战，虽然打败了他，但这一切都被曾经让火箭队所利用的人造神奇宝贝——超梦所看在眼里。小智和其中一些训练家来到了超梦的老巢，超梦用克隆出来的御三家神奇宝贝和小智等人进行战斗，最后输给了超梦。超梦还抓走了训练家的神奇宝贝，小智凭一己之力救出了神奇宝贝们。超梦和梦幻的大战在开始后没多久，小智便跑了过去吃了两击波导弹，也因此石化。最后神奇宝贝们留下了感动，伤心的泪水救活了小智。超梦将他们传送回去并消除了他们的记忆。

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