壳聚糖和它们的衍生物对一些菌、酵母等微生物都有很好的抑制作用 ,对一般人体表皮存在的xi菌如表皮葡萄球菌，大肠杆菌和热带白色nian珠菌以及被烧烫的伤口病人易出现的绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌和化脓性金黄色葡萄球菌感染等都有显著的抑制作用。
目前，对这类材料确切的抑菌机理还不是很清楚。一种看法认为：由于壳聚糖分子中所带的正电荷和微生物细胞膜所带的负电荷的相互作用，导致xi菌的蛋白质和其它细胞成分的泄漏而产生抑菌作用。pH 值较小时,壳聚糖分子链上的C-2位置所带的正电荷比甲壳素多,其抑菌性能也比甲壳素好。
Cuero 等认为,壳聚糖由于分子 内丰富的羟基和氨基，可以作为鳌合剂选择性地键合微量金属从而抑制毒素的产生和微生物的生长。此外，壳聚糖可以激发许多组织的抵抗能力；作为一种水性键合剂并抑制不同的酶；低分子量的壳聚糖可以进入微生物的细胞，通过抑制 DNA转变为RNA来抑制细胞的生长。
羧宁液体伤口敷料的抑菌效果还要高于壳聚糖，是由羧氨基壳聚糖衍生物、有机硅抑菌剂组成的，双重杀掉菌的效果，保护创面，加快伤口愈合。