从文章表现来看，不考虑凭空生成灵根，以及限制大已经被淘汰的器灵根，丹灵根应该是灵界化神修士补齐灵根五行合一的主要方式，而10级妖兽内丹这个主材对化神修士简单的很多，也只有人界灵气太低需要靠元磁神光突破化神，才需要在元婴期就补齐灵根

后天灵根毕竟是修仙界研究出来的东西，自然不是开始就有。
推测一种可能性：
最早的人界-灵界，天灵根修行快，但是都无法突破五行合一的关隘，化神就是最高境界。
之后，有五行灵根齐全的大毅力人士，修炼到化神，感悟五行合一，成功突破炼虚。
此时，灵根就出现了两极分化：
天灵根、异灵根，修炼迅速到化神。但是无法突破到炼虚。
五灵根修炼极难，只能靠海量的资源去硬堆，但是只要堆到化神，之后练到炼虚，此时他就是最强者，就可以搜刮资源供自己修炼，继续前进到合体、乃至大乘——只要整个灵界的资源足够。
而五灵根修炼过于缓慢，需要资源过于繁杂。就有人去研究，4灵根跟5灵根接近，但是修炼速度、资源依赖比5灵根相对来说好很多，能不能通过某种方式给4灵根用法宝等外物来补齐灵根。进而研发出了器灵根。
器灵根成功之后，自然有人想着，4灵根可以补，3灵根呢？天灵根呢？再大量尝试后，发现器灵根只能补一个。
那自然有人就会想着从其他方式来补充灵根来打破器灵根只补一个的限制。丹灵根就被研究出来了。
大家发现丹灵根可以补多个灵根，而补灵根的消耗，远小于多灵根修炼到化神的资源消耗。把4、5灵根堆到化神的消耗资源，不如给天灵根、2灵根修炼到化神再补灵根。4、5灵根再次被抛弃了，沦为最垃圾的修炼体质。
这时候，有些大能的子嗣没有灵根没法修炼。看到别人有灵根的可以补灵根，自然就会去研究没有灵根的能不能凭空生灵根，最后研究出来几种灵药。